RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 SUSD4Q5VX71 490 aa29.55■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 AK7Q96M32 723 aa29.55■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 BOLA2Q9H3K6 86 aa29.55■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 ANO2Q9NQ90 1003 aa29.55■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 SGSM2O43147 1006 aa29.54■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 DBNDD2Q9BQY9 259 aa29.54■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.53■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 IL25Q9H293 177 aa29.53■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.53■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 SH3TC1Q8TE82 1336 aa29.52■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 CLEC4GQ6UXB4 293 aa29.52■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 GREM2Q9H772 168 aa29.52■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa29.52■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 ITGA6P23229 1130 aa29.51■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF609O15014 1411 aa29.51■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 BCORQ6W2J9 1755 aa29.51■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 RUFY2Q8WXA3 655 aa29.51■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.51■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.51■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 RGL2O15211 777 aa29.5■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 MCCP23508 829 aa29.5■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 SBF2Q86WG5 1849 aa29.49■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.49■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 HIP1O00291 1037 aa29.49■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 MYH3P11055 1940 aa29.49■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 NEUROD6Q96NK8 337 aa29.48■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 TIMM10P62072 90 aa29.48■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 RPS6KA4O75676 772 aa29.47■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 NTSR2O95665 410 aa29.47■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 A0A1B0GUL7 405 aa29.46■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 AKAP2Q9Y2D5 859 aa29.46■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 LY75O60449 1722 aa29.46■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 ANAPC15P60006 121 aa29.46■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 HAUS7Q99871 368 aa29.46■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa29.46■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 FAM177BA6PVY3 158 aa29.45■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa29.45■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 FSD1Q9BTV5 496 aa29.45■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 ANTXR1Q9H6X2 564 aa29.45■■■□□ 2.31
SERF1B-201ENST00000380750 RAD50Q92878 1312 aa29.45■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 IL17RAQ96F46 866 aa29.44■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa29.43■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 RIC1Q4ADV7 1423 aa29.42■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 SCN7AQ01118 1682 aa29.42■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 GNPATO15228 680 aa29.42■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 HSPA4P34932 840 aa29.42■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 NARFQ9UHQ1 456 aa29.42■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 PALD1Q9ULE6 856 aa29.41■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 RFX7Q2KHR2 1363 aa29.41■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 METTL24Q5JXM2 366 aa29.4■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 CNNM1Q9NRU3 951 aa29.4■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 LRP5O75197 1615 aa29.4■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.4■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa29.4■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 SNRKQ9NRH2 765 aa29.4■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 ST18O60284 1047 aa29.39■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.39■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 FAM227BQ96M60 508 aa29.39■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.39■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
SERF1B-201ENST00000380750 NBR1Q14596 966 aa29.38■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 SMIM5Q71RC9 77 aa29.38■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 LAMB2P55268 1798 aa29.38■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 TAF1LQ8IZX4 1826 aa29.38■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 RTL9Q8NET4 1388 aa29.38■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC152Q4G0S7 254 aa29.38■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 USPL1Q5W0Q7 1092 aa29.38■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa29.38■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 XAGE2Q96GT9 111 aa29.37■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.36■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 A0A0D9SFI3 127 aa29.36■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 ZPR1O75312 459 aa29.36■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 ATP2B3Q16720 1220 aa29.36■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC158Q5M9N0 1113 aa29.36■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 C4BP0C0L5 1744 aa29.35■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 ADORA1P30542 326 aa29.35■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 TBC1D9BQ66K14 1250 aa29.35■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 TICAM2Q86XR7 235 aa29.35■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 KBTBD3Q8NAB2 608 aa29.35■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 PAG1Q9NWQ8 432 aa29.35■■■□□ 2.29
SERF1B-201ENST00000380750 GORABQ5T7V8 394 aa29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms