RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376582.7

TIMM17B-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM17B, Length 950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-201ENST00000376582 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
TIMM17B-201ENST00000376582 UTYO14607 1347 aa23.92■■□□□ 1.42
TIMM17B-201ENST00000376582 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
TIMM17B-201ENST00000376582 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TIMM17B-201ENST00000376582 USP44Q9H0E7 712 aa23.92■■□□□ 1.42
TIMM17B-201ENST00000376582 TNNQ9UQP3 1299 aa23.92■■□□□ 1.42
TIMM17B-201ENST00000376582 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TIMM17B-201ENST00000376582 CSF1RP07333 972 aa23.91■■□□□ 1.42
TIMM17B-201ENST00000376582 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TIMM17B-201ENST00000376582 SLX4Q8IY92 1834 aa23.9■■□□□ 1.42
TIMM17B-201ENST00000376582 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TIMM17B-201ENST00000376582 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.9■■□□□ 1.42
TIMM17B-201ENST00000376582 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.9■■□□□ 1.42
TIMM17B-201ENST00000376582 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 FOXO4P98177 505 aa23.89■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 CCDC93Q567U6 631 aa23.89■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.89■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.89■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 OLFM4Q6UX06 510 aa23.88■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 SP8Q8IXZ3 490 aa23.88■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.88■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 TMC4Q7Z404 712 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 SUCLG2Q96I99 432 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 GREM2Q9H772 168 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 LAMB2P55268 1798 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 NFKBIEO00221 500 aa23.86■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.86■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.86■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 KAZALD1Q96I82 304 aa23.86■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 RTL9Q8NET4 1388 aa23.86■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.85■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 RASSF7Q02833 373 aa23.84■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.84■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 MS4A1P11836 297 aa23.83■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 ITGA6P23229 1130 aa23.83■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 FAM161AQ3B820 660 aa23.83■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.83■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.83■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.83■■□□□ 1.41
TIMM17B-201ENST00000376582 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.83■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 SLC51AQ86UW1 340 aa23.82■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 MEIS3Q99687 375 aa23.82■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.81■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 GNAI3P08754 354 aa23.81■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 RLBP1P12271 317 aa23.81■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.81■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 PLIN1O60240 522 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 LMNB1P20700 586 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 CACNA1SQ13698 1873 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 MPNDQ8N594 471 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 PSMD1Q99460 953 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 YY1P25490 414 aa23.79■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 PRELPP51888 382 aa23.79■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.79■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 PANK1Q8TE04 598 aa23.79■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 SNED1Q8TER0 1413 aa23.78■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 UTRNP46939 3433 aa23.78■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 RNF181Q9P0P0 153 aa23.78■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.77■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.77■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 TAF1P21675 1872 aa23.77■■□□□ 1.4
TIMM17B-201ENST00000376582 COL4A1P02462 1669 aa23.76■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 GPSM2P81274 684 aa23.76■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.76■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 MYH3P11055 1940 aa23.75■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.75■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.75■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.75■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 GNAI2P04899 355 aa23.73■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 PDE3AQ14432 1141 aa23.73■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 VPS33BQ9H267 617 aa23.73■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.73■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.73■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 CHD4Q14839 1912 aa23.72■■□□□ 1.39
TIMM17B-201ENST00000376582 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms