RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 CRKLP46109 303 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 ITPK1Q13572 414 aa28.67■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 SSFA2P28290 1259 aa28.66■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.66■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 CCDC171Q6TFL3 1326 aa28.66■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 CIAO1O76071 339 aa28.65■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.65■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 PALLDQ8WX93 1383 aa28.65■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.65■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 CHGBP05060 677 aa28.64■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 CSF1RP07333 972 aa28.64■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 EIF5P55010 431 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.64■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 MCM2P49736 904 aa28.64■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 HAUS7Q99871 368 aa28.64■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 GPR108Q9NPR9 543 aa28.64■■■□□ 2.18
LHX3-201ENST00000371746 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.63■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 PKP1Q13835 747 aa28.63■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 A0A1B0GUL7 405 aa28.63■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 JCADQ9P266 1359 aa28.63■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.63■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 TAF7LQ5H9L4 462 aa28.62■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 ZNF609O15014 1411 aa28.62■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 GREM2Q9H772 168 aa28.62■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.62■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 VPS72Q15906 364 aa28.61■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.61■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 CPA1P15085 419 aa28.6■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 SNRKQ9NRH2 765 aa28.6■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 MED23Q9ULK4 1368 aa28.6■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 CTSWP56202 376 aa28.6■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 ITGA6P23229 1130 aa28.59■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 KCNJ4P48050 445 aa28.59■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 NECTIN1Q15223 517 aa28.59■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.59■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.59■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 MAP4K1Q92918 833 aa28.59■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 CASTP20810 708 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 GBP4Q96PP9 640 aa28.58■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 GOLIM4O00461 696 aa28.58■■■□□ 2.17
LHX3-201ENST00000371746 FAM177BA6PVY3 158 aa28.57■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 TTC14Q96N46 770 aa28.57■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 NUP98P52948 1817 aa28.57■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.57■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 CUL4AQ13619 759 aa28.57■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 ADORA1P30542 326 aa28.56■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 KCNQ4P56696 695 aa28.56■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 CREB3L3Q68CJ9 461 aa28.56■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.56■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 PAG1Q9NWQ8 432 aa28.55■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 FBXO3Q9UK99 471 aa28.55■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 NUCB2P80303 420 aa28.55■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.55■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 KCNB2Q92953 911 aa28.55■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.55■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 AK2P54819 239 aa28.54■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa28.54■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 CAMTA2O94983 1202 aa28.54■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 SLFNL1Q499Z3 407 aa28.54■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 SUSD4Q5VX71 490 aa28.54■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa28.54■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 TRAK2O60296 914 aa28.53■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 PDE8AO60658 829 aa28.53■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 TAF5LO75529 589 aa28.53■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 USP21Q9UK80 565 aa28.53■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.52■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 SLC27A2O14975 620 aa28.52■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 XAGE2Q96GT9 111 aa28.52■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.52■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.52■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.52■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.52■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 RFX7Q2KHR2 1363 aa28.52■■■□□ 2.16
LHX3-201ENST00000371746 METTL24Q5JXM2 366 aa28.51■■■□□ 2.15
LHX3-201ENST00000371746 GORABQ5T7V8 394 aa28.51■■■□□ 2.15
LHX3-201ENST00000371746 RUFY3Q7L099 469 aa28.51■■■□□ 2.15
LHX3-201ENST00000371746 ZDHHC9Q9Y397 364 aa28.51■■■□□ 2.15
LHX3-201ENST00000371746 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
LHX3-201ENST00000371746 FAM182BQ5T319 152 aa28.5■■■□□ 2.15
LHX3-201ENST00000371746 CNNM1Q9NRU3 951 aa28.5■■■□□ 2.15
LHX3-201ENST00000371746 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms