RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 MAPK1P28482 360 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 XKR5Q6UX68 686 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 BHMTQ93088 406 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 EFCC1Q9HA90 598 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 KLF15Q9UIH9 416 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAMTS2O95450 1211 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 SYT9Q86SS6 491 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 NLRP13Q86W25 1043 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC16Q8NEE8 873 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 PNMA5Q96PV4 448 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFATQ9P243 1243 aa6.95□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGEF15O94989 841 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP3K6O95382 1288 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHA1P01876 353 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 ARAFP10398 606 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 NFKB1P19838 968 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 EHHADHQ08426 723 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 NEUROD1Q13562 356 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 KANK3Q6NY19 840 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 TMC1Q8TDI8 760 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM129BQ96TA1 746 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 ELP3Q9H9T3 547 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 SIN3BO75182 1162 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHA2P01877 340 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 RARAP10276 462 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP3K10Q02779 954 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 PDE3BQ13370 1112 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC27Q2M243 656 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 TMC7Q7Z402 723 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 ACDQ96AP0 544 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 MMP20O60882 483 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 ADH6P28332 368 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 GGA1Q9UJY5 639 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR182O15218 404 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 ASB16Q96NS5 453 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 CNTN3Q9P232 1028 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFRSF21O75509 655 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFRSF25Q93038 417 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 MDFIQ99750 246 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-202ENST00000370826 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 TREHO43280 583 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 PLCB3Q01970 1234 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 DSC3Q14574 896 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 OR13H1Q8NG92 308 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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RABGGTB-202ENST00000370826 CHRDQ9H2X0 955 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 IGFLR1Q9H665 355 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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RABGGTB-202ENST00000370826 OIP5O43482 229 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 PSAPP07602 524 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 BCRP11274 1271 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 EPXP11678 715 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 SOX18P35713 384 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 PHACTR2O75167 634 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 NEFLP07196 543 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 NRLP54845 237 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 PLAURQ03405 335 aa6.87□□□□□ -1.31
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