RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367760.7

PRRX1-202, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 2,217 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-202ENST00000367760 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 HAUS7Q99871 368 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 ATG3Q9NT62 314 aa20.31■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 TJP1Q07157 1748 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 STX6O43752 255 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 KRT32Q14532 448 aa20.3■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 A1BGP04217 495 aa20.29■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.29■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 STRN4Q9NRL3 753 aa20.29■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.29■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.28■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 TAF5LO75529 589 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 CIAO1O76071 339 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 CPA1P15085 419 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 SYT1P21579 422 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 PHF14O94880 888 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.27■□□□□ 0.84
PRRX1-202ENST00000367760 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 FBXO3Q9UK99 471 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 PALLDQ8WX93 1383 aa20.26■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 LARGE1O95461 756 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 F13A1P00488 732 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 RPS6KB1P23443 525 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 GJB2P29033 226 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 EYA2O00167 538 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.25■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 ME3Q16798 604 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 USP48Q86UV5 1035 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 KLHL34Q8N239 644 aa20.24■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 TCIRG1Q13488 830 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 PDCP20941 246 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF609O15014 1411 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 SPEF2Q9C093 1822 aa20.23■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 TPM2P07951 284 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 STARD3NLO95772 234 aa20.22■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 SYCE3A1L190 88 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 RBSNQ9H1K0 784 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 UBE2HP62256 183 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 MTMR6Q9Y217 621 aa20.21■□□□□ 0.83
PRRX1-202ENST00000367760 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 ST3GAL1Q11201 340 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 NEK1Q96PY6 1258 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.19■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 LRP6O75581 1613 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 PIGBQ92521 554 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 TSPY26PQ9H489 355 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 DISP2A7MBM2 1401 aa20.18■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PRRX1-202ENST00000367760 HS1BP3Q53T59 392 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms