RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365200.1

RNU6-1175P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1175, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1175P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IFT43Q96FT9 208 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZFATQ9P243 1243 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LRFN2Q9ULH4 789 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OPLAHO14841 1288 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SASH3O75995 380 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RARAP10276 462 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CPB1P15086 417 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SELPP16109 830 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TARSP26639 723 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ADGRE1Q14246 886 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NKAPLQ5M9Q1 402 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 COX20Q5RI15 118 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 XP32Q5T750 250 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TREML1Q86YW5 311 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TTC9Q92623 222 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PRIMPOLQ96LW4 560 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LPIN3Q9BQK8 851 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PRMT3O60678 531 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NRLP54845 237 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GRIK5Q16478 980 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OCLNQ16625 522 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PERM1Q5SV97 790 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MSL1Q68DK7 614 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 COL26A1Q96A83 441 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DYRK3O43781 588 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 XYLBO75191 536 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ATG7O95352 703 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BRD2P25440 801 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FAM69CQ0P6D2 419 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MBTPS1Q14703 1052 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C16orf46Q6P387 395 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TXNRD3Q86VQ6 643 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 Q8N3U1 123 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 STK32AQ8WU08 396 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 USP20Q9Y2K6 914 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PSAPP07602 524 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PLAURQ03405 335 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SHISA2Q6UWI4 295 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FBXO11Q86XK2 927 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 WFDC8Q8IUA0 241 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SAP130Q9H0E3 1048 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KCNMB2Q9Y691 235 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 H2AFB2P0C5Z0 115 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SOX18P35713 384 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZMYND15Q9H091 742 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FAM13BQ9NYF5 915 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 USP21Q9UK80 565 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MMP20O60882 483 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GHRHP01286 108 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SIK1P57059 783 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TMEM164Q5U3C3 297 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NLRP13Q86W25 1043 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PBXIP1Q96AQ6 731 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PLD4Q96BZ4 506 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 J3QW42 95 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TNFRSF10BO14763 440 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PRSS36Q5K4E3 855 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IGF2-ASQ6U949 168 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PIK3R5Q8WYR1 880 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MKNK1Q9BUB5 465 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RBSNQ9H1K0 784 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 UBAP1LF5GYI3 381 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FAM26DQ5JW98 314 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CAPN12Q6ZSI9 719 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ABTB2Q8N961 1025 aa4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms