RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 ERBB3P21860 1342 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 MED23Q9ULK4 1368 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 MEGF6O75095 1541 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 FOSBP53539 338 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 CHRNA2Q15822 529 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 SLC52A2Q9HAB3 445 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 PPFIA3O75145 1194 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 PHKG2P15735 406 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 NEXNQ0ZGT2 675 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 SPC24Q8NBT2 197 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 TSC1Q92574 1164 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 KIF1AQ12756 1690 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 MST1RQ04912 1400 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 KDM4AO75164 1064 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 MCM5P33992 734 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 TNNI3KQ59H18 835 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 DDX11Q96FC9 970 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF609O15014 1411 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 A0A0G2JLW4 131 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 HIP1O00291 1037 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 TAF5LO75529 589 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 PSMA5P28066 241 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 UVSSAQ2YD98 709 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRR-202ENST00000342084 FAM177BA6PVY3 158 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 KRT85P78386 507 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 SNRKQ9NRH2 765 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 MRC1P22897 1456 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 A0A087WZG4 1122 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 CYP27B1O15528 508 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 RNF20Q5VTR2 975 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 DACT1Q9NYF0 836 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 JCADQ9P266 1359 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 Q6ZUG5 572 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 LUZP1Q86V48 1076 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 BRF1Q92994 677 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 SPATA32Q96LK8 384 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 NUP62CLQ9H1M0 184 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 COPRSQ9NQ92 184 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 ALS2Q96Q42 1657 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 CYP21A2P08686 494 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 ATP5JP18859 108 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 TERF1P54274 439 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 TYRO3Q06418 890 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 LMBR1LQ6UX01 489 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 PGBD1Q96JS3 809 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 NEK1Q96PY6 1258 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 A0A087WWV3 80 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 GOLIM4O00461 696 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 NR1I2O75469 434 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC192P0DO97 292 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 ANKRD1Q15327 319 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 MAP3K11Q16584 847 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRR-202ENST00000342084 ANO6Q4KMQ2 910 aa8.62□□□□□ -1.03
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