RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340369.3

XIRP1-201, Transcript of xin actin binding repeat containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene XIRP1, Length 6,460 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1-201ENST00000340369 SHTN1A0MZ66 631 aa14.56□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 KIF5CO60282 957 aa14.56□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.56□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 NPATQ14207 1427 aa14.56□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.56□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 TRPM2O94759 1503 aa14.56□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 KIF22Q14807 665 aa14.56□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 GBP3Q9H0R5 595 aa14.56□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 ZSCAN12O43309 604 aa14.55□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 PPIP5K2O43314 1243 aa14.55□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.55□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.55□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 MX1P20591 662 aa14.55□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.55□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 LUZP1Q86V48 1076 aa14.55□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 ANO10Q9NW15 660 aa14.55□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 URI1O94763 535 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 NLRP5P59047 1200 aa14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 B4DLN1 442 aa14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 ATP2B3Q16720 1220 aa14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 HOXC9P31274 260 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 PIK3R4Q99570 1358 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 TNNT1P13805 278 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 C8orf76Q96K31 380 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 GGA1Q9UJY5 639 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 ADAMTS12P58397 1594 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 MAP9Q49MG5 647 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 VPS36Q86VN1 386 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 IP6K1Q92551 441 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 TMEM94Q12767 1356 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 UBE4AQ14139 1066 aa14.52□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.52□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 PDE6BP35913 854 aa14.52□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.52□□□□□ -0.08
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.52□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.52□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa14.52□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.52□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.52□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 HAND2P61296 217 aa14.51□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.51□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.51□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 CBX1P83916 185 aa14.51□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.51□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.51□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.51□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 FLT4P35916 1363 aa14.51□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 STAMBPO95630 424 aa14.51□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 ALDH1B1P30837 517 aa14.51□□□□□ -0.09
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XIRP1-201ENST00000340369 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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XIRP1-201ENST00000340369 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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XIRP1-201ENST00000340369 KIF5BP33176 963 aa14.5□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 BICD1Q96G01 975 aa14.5□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.5□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 MYZAPP0CAP1 466 aa14.5□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 KIAA0556O60303 1618 aa14.5□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
XIRP1-201ENST00000340369 CNNM3Q8NE01 707 aa14.49□□□□□ -0.09
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