RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 USP44Q9H0E7 712 aa33.74■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 CTSWP56202 376 aa33.72■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 TTLL11Q8NHH1 800 aa33.71■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 HDAC5Q9UQL6 1122 aa33.71■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 TNNQ9UQP3 1299 aa33.71■■■□□ 2.99
CRIP1-201ENST00000330233 BBOX1O75936 387 aa33.69■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 TAF1P21675 1872 aa33.69■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 CSF1RP07333 972 aa33.68■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 GRAPQ13588 217 aa33.67■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 SOGA3Q5TF21 947 aa33.67■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM57Q8N5G2 664 aa33.67■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 FOXO4P98177 505 aa33.66■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 C21orf2O43822 256 aa33.65■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 C7orf43Q8WVR3 580 aa33.65■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 GNAI3P08754 354 aa33.64■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 TMC4Q7Z404 712 aa33.64■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 SUCLG2Q96I99 432 aa33.64■■■□□ 2.98
CRIP1-201ENST00000330233 PLIN1O60240 522 aa33.63■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa33.63■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 RTL9Q8NET4 1388 aa33.63■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 RLBP1P12271 317 aa33.62■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 RPS8P62241 208 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa33.62■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 GRIPAP1Q4V328 841 aa33.61■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 LMBR1LQ6UX01 489 aa33.61■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 KAZALD1Q96I82 304 aa33.61■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 GREM2Q9H772 168 aa33.61■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 SEC31BQ9NQW1 1179 aa33.61■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 PDE3AQ14432 1141 aa33.6■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 EPHA10Q5JZY3 1008 aa33.6■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 ITPRIPQ8IWB1 547 aa33.6■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 SP8Q8IXZ3 490 aa33.59■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 PANK1Q8TE04 598 aa33.59■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 MEIS3Q99687 375 aa33.59■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa33.59■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 CHD4Q14839 1912 aa33.59■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC93Q567U6 631 aa33.58■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa33.58■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 RTKN2Q8IZC4 609 aa33.58■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 ITGA6P23229 1130 aa33.57■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 CHMP3Q9Y3E7 222 aa33.57■■■□□ 2.97
CRIP1-201ENST00000330233 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa33.57■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa33.56■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC57Q2TAC2 916 aa33.55■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 FAM161AQ3B820 660 aa33.55■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 MVPQ14764 893 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD44Q8N8A2 993 aa33.53■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 GNAI2P04899 355 aa33.52■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 RRP1P56182 461 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 OLFM4Q6UX06 510 aa33.52■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 SBF1O95248 1867 aa33.52■■■□□ 2.96
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa33.51■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 MPHOSPH8Q99549 860 aa33.51■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 DDX19BQ9UMR2 479 aa33.51■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 COG6Q9Y2V7 657 aa33.5■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 SPEF2Q9C093 1822 aa33.49■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 LTBP3Q9NS15 1303 aa33.49■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 TAF7LQ5H9L4 462 aa33.49■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 TAOK3Q9H2K8 898 aa33.49■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP33.48■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 PSMD1Q99460 953 aa33.48■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 COL4A1P02462 1669 aa33.47■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 UTRNP46939 3433 aa33.47■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC37AA6NMS7 1700 aa33.47■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 NFKBIEO00221 500 aa33.47■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 C20orf194Q5TEA3 1177 aa33.47■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 MPNDQ8N594 471 aa33.47■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
CRIP1-201ENST00000330233 SUPT20HQ8NEM7 779 aa33.44■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 SNED1Q8TER0 1413 aa33.43■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 LMNB1P20700 586 aa33.43■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 RASSF7Q02833 373 aa33.43■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa33.43■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 MINPP1Q9UNW1 487 aa33.43■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 MTX1Q13505 466 aa33.42■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP33.42■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms