RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 A0A087WWV3 80 aa25.7■■□□□ 1.71
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ELL3-201ENST00000319359 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.7■■□□□ 1.71
ELL3-201ENST00000319359 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
ELL3-201ENST00000319359 MED23Q9ULK4 1368 aa25.7■■□□□ 1.7
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ELL3-201ENST00000319359 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.7■■□□□ 1.7
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ELL3-201ENST00000319359 ARID5BQ14865 1188 aa25.68■■□□□ 1.7
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ELL3-201ENST00000319359 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.66■■□□□ 1.7
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ELL3-201ENST00000319359 Q6ZUG5 572 aa25.64■■□□□ 1.7
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ELL3-201ENST00000319359 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.57■■□□□ 1.68
ELL3-201ENST00000319359 SMTNL1A8MU46 457 aa25.57■■□□□ 1.68
ELL3-201ENST00000319359 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
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ELL3-201ENST00000319359 PSME1Q06323 249 aa25.56■■□□□ 1.68
ELL3-201ENST00000319359 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
ELL3-201ENST00000319359 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.56■■□□□ 1.68
ELL3-201ENST00000319359 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
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