RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318121.7

CLSPN-202, Transcript of claspin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSPN, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPN-202ENST00000318121 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 GPATCH3Q96I76 525 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 CASP7P55210 303 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 SMC5Q8IY18 1101 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 MTFR1LQ9H019 292 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 COPRSQ9NQ92 184 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 MSL1Q68DK7 614 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 CSF1RP07333 972 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 POLA2Q14181 598 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 APBB1O00213 710 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 ITGA6P23229 1130 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 FOXO4P98177 505 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 TMC4Q7Z404 712 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CLSPN-202ENST00000318121 NUP188Q5SRE5 1749 aa7.15□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.15□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa7.15□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 H0YIN7 160 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 EYA2O00167 538 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 ALDH1B1P30837 517 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 SCN7AQ01118 1682 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 CIAO1O76071 339 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 IGHDP01880 384 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 FAM161AQ3B820 660 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 RTL9Q8NET4 1388 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 EPHA10Q5JZY3 1008 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 GORABQ5T7V8 394 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 SIL1Q9H173 461 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 BCORQ6W2J9 1755 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 DDR1Q08345 913 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 METTL24Q5JXM2 366 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 CHD1LQ86WJ1 897 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 KAZALD1Q96I82 304 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 SPON1Q9HCB6 807 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 BBOX1O75936 387 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 NPR1P16066 1061 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 CNKSR1Q969H4 720 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 ANKRD2Q9GZV1 360 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 GREM2Q9H772 168 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 KCNJ4P48050 445 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 SYNE4Q8N205 404 aa7.13□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 ZBTB7AO95365 584 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.278e-7■■■□□ 16.6
CLSPN-202ENST00000318121 MASTLQ96GX5 879 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 LNPKQ9C0E8 428 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 MROH5Q6ZUA9 1318 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 ERC2O15083 957 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 NUCB1Q02818 461 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 RGS3P49796 1198 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 GRAPQ13588 217 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 GPR108Q9NPR9 543 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.12□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 C4AP0C0L4 1744 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 SLC5A1P13866 664 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 QSER1Q2KHR3 1735 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 ABCC12Q96J65 1359 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 STYK1Q6J9G0 422 aa7.11□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLSPN-202ENST00000318121 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms