RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 CNKSR1Q969H4 720 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 UTRNP46939 3433 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 ALDH1B1P30837 517 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 GPR162Q16538 588 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 SUCLG2Q96I99 432 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 MEIS3Q99687 375 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 CRAMP1Q96RY5 1269 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 SPEF2Q9C093 1822 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 FOXO4P98177 505 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXD4-201ENST00000306324 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 KAZALD1Q96I82 304 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 GNAI3P08754 354 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 PDE3AQ14432 1141 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 LMBR1LQ6UX01 489 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 GREM2Q9H772 168 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 COG6Q9Y2V7 657 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 COL4A1P02462 1669 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 CSF1RP07333 972 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 GRAPQ13588 217 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 C21orf2O43822 256 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 FAM161AQ3B820 660 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 ITGA6P23229 1130 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 RTL9Q8NET4 1388 aa28.01■■■□□ 2.08
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
HOXD4-201ENST00000306324 BBOX1O75936 387 aa28■■■□□ 2.07
HOXD4-201ENST00000306324 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
HOXD4-201ENST00000306324 DDX19BQ9UMR2 479 aa28■■■□□ 2.07
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HOXD4-201ENST00000306324 OLFM4Q6UX06 510 aa27.98■■■□□ 2.07
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.98■■■□□ 2.07
HOXD4-201ENST00000306324 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa27.97■■■□□ 2.07
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HOXD4-201ENST00000306324 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXD4-201ENST00000306324 SOGA3Q5TF21 947 aa27.95■■■□□ 2.07
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.95■■■□□ 2.07
HOXD4-201ENST00000306324 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.95■■■□□ 2.07
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HOXD4-201ENST00000306324 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
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HOXD4-201ENST00000306324 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.95■■■□□ 2.06
HOXD4-201ENST00000306324 TMC4Q7Z404 712 aa27.95■■■□□ 2.06
HOXD4-201ENST00000306324 SP8Q8IXZ3 490 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXD4-201ENST00000306324 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
HOXD4-201ENST00000306324 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa27.92■■■□□ 2.06
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HOXD4-201ENST00000306324 SBF1O95248 1867 aa27.91■■■□□ 2.06
HOXD4-201ENST00000306324 RTKN2Q8IZC4 609 aa27.9■■■□□ 2.06
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HOXD4-201ENST00000306324 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.88■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.88■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 CRBNQ96SW2 442 aa27.88■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 NFKBIEO00221 500 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 MPNDQ8N594 471 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1B0GUL6 1792 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXD4-201ENST00000306324 SNED1Q8TER0 1413 aa27.87■■■□□ 2.05
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