RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 FOXO4P98177 505 aa23■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 PRDM11Q9NQV5 511 aa23■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.99■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.99■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.99■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 TSPY26PQ9H489 355 aa22.99■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.99■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 CPDO75976 1380 aa22.99■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 STK3Q13188 491 aa22.98■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.98■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.98■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 RPS6KB1P23443 525 aa22.97■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 TIMM10P62072 90 aa22.97■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 FERMT3Q86UX7 667 aa22.97■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 H7C1W4 665 aa22.97■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 PSMA5P28066 241 aa22.97■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF609O15014 1411 aa22.97■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 RNF20Q5VTR2 975 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.96■■□□□ 1.27
LPCAT3-201ENST00000261407 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 ABCC6O95255 1503 aa22.95■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 UBE2HP62256 183 aa22.94■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 LRRC24Q50LG9 513 aa22.94■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 JCADQ9P266 1359 aa22.94■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 HAUS7Q99871 368 aa22.94■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 STRN4Q9NRL3 753 aa22.94■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.94■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.94■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.93■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 CYP21A2P08686 494 aa22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 GOLIM4O00461 696 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 MPNDQ8N594 471 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 A0A0G2JLW4 131 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.9■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.9■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.89■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 JAK2O60674 1132 aa22.89■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 PHF14O94880 888 aa22.89■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 NEK1Q96PY6 1258 aa22.89■■□□□ 1.26
LPCAT3-201ENST00000261407 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.89■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 IL2RBP14784 551 aa22.88■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.88■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 TTC6Q86TZ1 520 aa22.88■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.88■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.88■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 ANKRD1Q15327 319 aa22.88■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 Q6ZUG5 572 aa22.88■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 HS1BP3Q53T59 392 aa22.87■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.87■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.86■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 SLAIN2Q9P270 581 aa22.86■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 USP25Q9UHP3 1055 aa22.85■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.85■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 DDX11Q96FC9 970 aa22.85■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 A0A1B0GUL7 405 aa22.84■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 EYA2O00167 538 aa22.84■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 BRF1Q92994 677 aa22.84■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 TJP1Q07157 1748 aa22.84■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.83■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 PPFIA3O75145 1194 aa22.83■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 GTF3C6Q969F1 213 aa22.83■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.83■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.83■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.83■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.83■■□□□ 1.25
LPCAT3-201ENST00000261407 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 180.6 ms