RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261302.9

FOXN3-201, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene FOXN3, Length 2,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-201ENST00000261302 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 TBC1D8O95759 1140 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 SYT1P21579 422 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 PSME1Q06323 249 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 SSH2Q76I76 1423 aa14.85□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 SUFUQ9UMX1 484 aa14.85□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.85□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 SASH3O75995 380 aa14.85□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.84□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 TPM1P09493 284 aa14.84□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.84□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 UBXN4Q92575 508 aa14.84□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.84□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 CAVIN2O95810 425 aa14.84□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 LMAN1P49257 510 aa14.84□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 CORO7P57737 925 aa14.84□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.84□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.84□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 ALS2Q96Q42 1657 aa14.83□□□□□ -0.03
FOXN3-201ENST00000261302 CCDC69A6NI79 296 aa14.83□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 ARID5BQ14865 1188 aa14.83□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 ACEP12821 1306 aa14.83□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 LRP6O75581 1613 aa14.83□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 ATP6V1AP38606 617 aa14.83□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.83□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 RPAINQ86UA6 219 aa14.83□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.83□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 E2F4Q16254 413 aa14.82□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.82□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 ATP10DQ9P241 1426 aa14.82□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 ZNF165P49910 485 aa14.82□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 CABP1Q9NZU7 370 aa14.82□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.82□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 AKAP12Q02952 1782 aa14.81□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 CCDC189A1A4V9 331 aa14.81□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 TNMDQ9H2S6 317 aa14.81□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.81□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 ARHGEF10O15013 1369 aa14.81□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.81□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 VAMP4O75379 141 aa14.81□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 MAP2K2P36507 400 aa14.81□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 TDO2P48775 406 aa14.81□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.8□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 TADA3O75528 432 aa14.8□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.8□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 NSD2O96028 1365 aa14.8□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 CAMK4Q16566 473 aa14.8□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.8□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 LIG1P18858 919 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 KCNJ6P48051 423 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 MTMR6Q9Y217 621 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 USP6P35125 1406 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.79□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 GSDMDP57764 484 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 TRDNQ13061 729 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 RAI14Q9P0K7 980 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 ABCA3Q99758 1704 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.78□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.77□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 FUT8Q9BYC5 575 aa14.77□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.77□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.77□□□□□ -0.04
FOXN3-201ENST00000261302 PDE1AP54750 535 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 IQCB1Q15051 598 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 TTC6Q86TZ1 520 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.77□□□□□ -0.05
FOXN3-201ENST00000261302 CCDC34Q96HJ3 373 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.3 ms