RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 KLRG1Q96E93 195 aa8.45□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.45□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 ADH1AP07327 375 aa8.44□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.44□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.44□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.44□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.44□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 SIAH2O43255 324 aa8.43□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 AMPD3Q01432 767 aa8.43□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 GRM2Q14416 872 aa8.43□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.43□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 KCNQ5Q9NR82 932 aa8.43□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.43□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.42□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 CBLBQ13191 982 aa8.42□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 NR5A1Q13285 461 aa8.42□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.42□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.42□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 CHRDQ9H2X0 955 aa8.42□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.42□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.42□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 F6X3S4 739 aa8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 PHACTR2O75167 634 aa8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 IER5Q5VY09 327 aa8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 TMEM74Q96NL1 305 aa8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 FANCLQ9NW38 375 aa8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 USP20Q9Y2K6 914 aa8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.41□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa8.4□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 POTEMA6NI47 508 aa8.4□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 CDC45O75419 566 aa8.4□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 GARTP22102 1010 aa8.4□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 PWP1Q13610 501 aa8.4□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 RHOVQ96L33 236 aa8.4□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 PRKAG3Q9UGI9 489 aa8.4□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.4□□□□□ -1.06
MDM2-201ENST00000258148 GSTT1P30711 240 aa8.39□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 IDH3AP50213 366 aa8.39□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.39□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 LILRB2Q8N423 598 aa8.39□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.39□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.39□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 ELP3Q9H9T3 547 aa8.39□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 MINDY4BA8MYZ0 360 aa8.38□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 RNF223E7ERA6 249 aa8.38□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 INPP5BP32019 993 aa8.38□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.38□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.38□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.38□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.38□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 SUSD3Q96L08 255 aa8.38□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 ESYT3A0FGR9 886 aa8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 EREGO14944 169 aa8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 GREM1O60565 184 aa8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 VEGFBP49765 207 aa8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 RELL1Q8IUW5 271 aa8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 SHDQ96IW2 340 aa8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.36□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 PTGIRP43119 386 aa8.36□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 ARSDP51689 593 aa8.36□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.36□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.36□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.36□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.36□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 TMX1Q9H3N1 280 aa8.36□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 RPIAP49247 311 aa8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 CHMP4BP1P59074 171 aa8.35□□□□□ -1.07
MDM2-201ENST00000258148 HIF1AQ16665 826 aa8.35□□□□□ -1.07
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