RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252771.11

FCHO1-201, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-201ENST00000252771 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 GPTP24298 496 aa20.51■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 NUP98P52948 1817 aa20.5■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 CIAO1O76071 339 aa20.5■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 RUFY3Q7L099 469 aa20.5■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.5■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.5■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 CSF1RP07333 972 aa20.5■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 PIP4K2BP78356 416 aa20.5■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 NLRP10Q86W26 655 aa20.5■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.49■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF609O15014 1411 aa20.49■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 JCADQ9P266 1359 aa20.49■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.49■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.49■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.49■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 IL27Q8NEV9 243 aa20.49■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.49■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.48■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.48■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.48■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.48■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 SLIT2O94813 1529 aa20.47■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 A0A1B0GUL7 405 aa20.47■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.47■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 SLC27A2O14975 620 aa20.47■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 TAF5LO75529 589 aa20.47■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.47■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 MCTP1Q6DN14 999 aa20.46■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.46■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.46■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.46■□□□□ 0.87
FCHO1-201ENST00000252771 LARGE1O95461 756 aa20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 BRD1O95696 1058 aa20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 FSD2A1L4K1 749 aa20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.45■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 KCNJ4P48050 445 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 VPS53Q5VIR6 699 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 MYH3P11055 1940 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 GOLIM4O00461 696 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 A0A0G2JS52 829 aa20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 PTMSP20962 102 aa20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 BARGINQ6ZT62 677 aa20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 GREM2Q9H772 168 aa20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 FBXO3Q9UK99 471 aa20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 PALLDQ8WX93 1383 aa20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.42■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 TOM1O60784 492 aa20.42■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 ADORA1P30542 326 aa20.42■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.42■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 ATP6V1AP38606 617 aa20.42■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 ITPK1Q13572 414 aa20.42■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 ITGA6P23229 1130 aa20.41■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.41■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.41■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 CTSWP56202 376 aa20.41■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 SIK1P57059 783 aa20.41■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.41■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 KCNQ2O43526 872 aa20.4■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.4■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.4■□□□□ 0.86
FCHO1-201ENST00000252771 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms