RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 MASTLQ96GX5 879 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 PDE8AO60658 829 aa24.45■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 NPR1P16066 1061 aa24.45■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.45■■□□□ 1.51
HOXD11-201ENST00000249504 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 CRY2Q49AN0 593 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 STYK1Q6J9G0 422 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 GNAI3P08754 354 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 CASP7P55210 303 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 TTLL6Q8N841 843 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 BCS1LQ9Y276 419 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 CNKSR1Q969H4 720 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 AAMPQ13685 434 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 GPR162Q16538 588 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 CTSWP56202 376 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 ALDH1B1P30837 517 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD11-201ENST00000249504 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
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HOXD11-201ENST00000249504 SLX4Q8IY92 1834 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 GNAI2P04899 355 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 SUCLG2Q96I99 432 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 KAZALD1Q96I82 304 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 TAF1P21675 1872 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 FOXO4P98177 505 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 GRAPQ13588 217 aa24.34■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 GREM2Q9H772 168 aa24.33■■□□□ 1.49
HOXD11-201ENST00000249504 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 CSF1RP07333 972 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 RTL9Q8NET4 1388 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 C21orf2O43822 256 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 GRIN3BO60391 1043 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 FAM161AQ3B820 660 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.31■■□□□ 1.48
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HOXD11-201ENST00000249504 BBOX1O75936 387 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
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HOXD11-201ENST00000249504 CEP85Q6P2H3 762 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 SPEF2Q9C093 1822 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 ITGA6P23229 1130 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 MTX1Q13505 466 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 ATP8B2P98198 1209 aa24.28■■□□□ 1.48
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HOXD11-201ENST00000249504 TMC4Q7Z404 712 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
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HOXD11-201ENST00000249504 CCDC93Q567U6 631 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 OLFM4Q6UX06 510 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 SP8Q8IXZ3 490 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 SRGAP3O43295 1099 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 POLA2Q14181 598 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 SSH3Q8TE77 659 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXD11-201ENST00000249504 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
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