RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 WTAPQ15007 396 aa8.27□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.27□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 ADAMTS12P58397 1594 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 KIF4AO95239 1232 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 PLCG2P16885 1265 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 ESR2Q92731 530 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 GOPCQ9HD26 462 aa8.26□□□□□ -1.09
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CPS1-201ENST00000233072 STK24Q9Y6E0 443 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 PIK3C2GO75747 1445 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 CCDC174Q6PII3 467 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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CPS1-201ENST00000233072 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 FERP16591 822 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 PPP1R2P41236 205 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 C6orf163Q5TEZ5 329 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 KLHL10Q6JEL2 608 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 SYCP3Q8IZU3 236 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.26□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 KLHL40Q2TBA0 621 aa8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 TMC6Q7Z403 805 aa8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 CEP112Q8N8E3 955 aa8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 DRC1Q96MC2 740 aa8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 TNNT1P13805 278 aa8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 SELENOOQ9BVL4 669 aa8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 ACEP12821 1306 aa8.25□□□□□ -1.09
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CPS1-201ENST00000233072 UBA7P41226 1012 aa8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 ATL3Q6DD88 541 aa8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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CPS1-201ENST00000233072 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.25□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD2Q9GZV1 360 aa8.25□□□□□ -1.09
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CPS1-201ENST00000233072 FLT4P35916 1363 aa8.24□□□□□ -1.09
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CPS1-201ENST00000233072 SSFA2P28290 1259 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 FERMT3Q86UX7 667 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 ACTN2P35609 894 aa8.24□□□□□ -1.09
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CPS1-201ENST00000233072 CTR9Q6PD62 1173 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 CERS3Q8IU89 383 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 MAP3K5Q99683 1374 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 ZBTB43O43298 467 aa8.24□□□□□ -1.09
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CPS1-201ENST00000233072 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 TRIM47Q96LD4 638 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 C6orf50Q9HD87 102 aa8.24□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 C6orf229H3BNL8 230 aa8.23□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 PRC1O43663 620 aa8.23□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 SYKP43405 635 aa8.23□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.23□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.23□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 WDR62O43379 1518 aa8.23□□□□□ -1.09
CPS1-201ENST00000233072 ATP8B2P98198 1209 aa8.23□□□□□ -1.09
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