RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000226382.3

PHOX2B-201, Transcript of paired like homeobox 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHOX2B, Length 3,030 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2B-201ENST00000226382 BECN2A8MW95 431 aa24.31■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 PDCP20941 246 aa24.31■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 CEP135Q66GS9 1140 aa24.31■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.31■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 CLSTN2Q9H4D0 955 aa24.31■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 C3P01024 1663 aa24.3■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 SASH1O94885 1247 aa24.3■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 PSMA5P28066 241 aa24.3■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 MAP4K1Q92918 833 aa24.3■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.3■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 SUCLG2Q96I99 432 aa24.29■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 SMTNL1A8MU46 457 aa24.29■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 KDRP35968 1356 aa24.29■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 ST7Q9NRC1 585 aa24.29■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 RPS6KB1P23443 525 aa24.29■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 ZBTB9Q96C00 473 aa24.29■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 ERICH4A6NGS2 130 aa24.28■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 SKILP12757 684 aa24.28■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.28■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.28■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.28■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 RNF20Q5VTR2 975 aa24.27■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.27■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 CHST3Q7LGC8 479 aa24.27■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 NBPF4Q96M43 638 aa24.27■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 ADCY9O60503 1353 aa24.27■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 USP31Q70CQ4 1352 aa24.27■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.27■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.27■■□□□ 1.48
PHOX2B-201ENST00000226382 MYL6BP14649 208 aa24.27■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 Q6ZUG5 572 aa24.27■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 CNPY4Q8N129 248 aa24.26■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.26■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 ELF2Q15723 593 aa24.26■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.25■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.25■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.25■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 PTPN14Q15678 1187 aa24.24■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 GORABQ5T7V8 394 aa24.24■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 ITSN1Q15811 1721 aa24.24■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 ISM2Q6H9L7 571 aa24.24■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 LRRC8AQ8IWT6 810 aa24.24■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 OGFRQ9NZT2 677 aa24.24■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 RICTORQ6R327 1708 aa24.24■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 CCDC69A6NI79 296 aa24.24■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.23■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 BIN1O00499 593 aa24.23■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 PTPN21Q16825 1174 aa24.23■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.23■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa24.23■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 ME1P48163 572 aa24.22■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.22■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 ELP1O95163 1332 aa24.22■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.21■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 KAZALD1Q96I82 304 aa24.21■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 A0A0G2JLW4 131 aa24.21■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.21■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 NEK1Q96PY6 1258 aa24.21■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PHOX2B-201ENST00000226382 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.2■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.2■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 APOBRQ0VD83 1088 aa24.2■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 SLC39A6Q13433 755 aa24.2■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 ANKRD1Q15327 319 aa24.2■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 GRM8O00222 908 aa24.19■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 APPP05067 770 aa24.19■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 RESTQ13127 1097 aa24.19■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 SCRN1Q12765 414 aa24.19■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.19■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.19■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 USP28Q96RU2 1077 aa24.19■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 FEZ1Q99689 392 aa24.19■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.19■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 TAF5LO75529 589 aa24.19■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.19■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 KINO60870 393 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 IQCB1Q15051 598 aa24.18■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.18■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa24.18■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.18■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 LRRN4CLQ8ND94 238 aa24.18■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 KIF18AQ8NI77 898 aa24.18■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 GTF3C6Q969F1 213 aa24.18■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 SDF4Q9BRK5 362 aa24.18■■□□□ 1.46
PHOX2B-201ENST00000226382 SMC2O95347 1197 aa24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms