RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 ST5P78524 1137 aa15.33■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 ANKRD1Q15327 319 aa15.33■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 CDC25BP30305 580 aa15.32■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 LMAN1P49257 510 aa15.32■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 GSDMDP57764 484 aa15.32■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa15.32■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.32■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.32■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 OAS2P29728 719 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 PLA2G4AP47712 749 aa15.32■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 MLECQ14165 292 aa15.32■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.32■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 TSPYL1Q9H0U9 437 aa15.31■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.31■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.31■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 CCT2P78371 535 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 SKIDA1Q1XH10 827 aa15.31■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 SMARCE1Q969G3 411 aa15.31■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.31■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.31■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 NECTIN1Q15223 517 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 TXLNBQ8N3L3 684 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 CAVIN2O95810 425 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 SLFNL1Q499Z3 407 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 TRIM66O15016 1216 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 RPS6KB1P23443 525 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 RASSF4Q9H2L5 321 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa15.3■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 EVCP57679 992 aa15.29■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 EVI5LQ96CN4 794 aa15.29■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 A0A1B0GVL5 298 aa15.29■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 ATP7BP35670 1465 aa15.29■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 A0A0D9SFI3 127 aa15.29■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 CTAGE5O15320 804 aa15.29■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 NUTM2GQ5VZR2 741 aa15.29■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 Q6ZUG5 572 aa15.29■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 PDILTQ8N807 584 aa15.29■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 IL17RAQ96F46 866 aa15.29■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 CHD1O14646 1710 aa15.29■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 ERBB3P21860 1342 aa15.28■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 ZSCAN26Q16670 478 aa15.28■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15.28■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 SARM1Q6SZW1 724 aa15.28■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 ASXL2Q76L83 1435 aa15.28■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 SERPINC1P01008 464 aa15.27■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 RESTQ13127 1097 aa15.27■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 C14orf37Q86TY3 774 aa15.27■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 USP28Q96RU2 1077 aa15.27■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa15.27■□□□□ 0.04
ITGA3-201ENST00000007722 CRB1P82279 1406 aa15.27■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC150Q8NCX0 1101 aa15.27■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 AK7Q96M32 723 aa15.27■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 TTC41PQ6P2S7 1318 aa15.26■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 TULP2O00295 520 aa15.26■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 ARMCX5Q6P1M9 558 aa15.26■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.26■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 GNAT3A8MTJ3 354 aa15.26■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.26■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.26■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.26■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 STK38Q15208 465 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 CFAP100Q494V2 611 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 MAP4K1Q92918 833 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 TOMM22Q9NS69 142 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 GNG11P61952 73 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 ETF1P62495 437 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 TEFQ10587 303 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 CREBRFQ8IUR6 639 aa15.25■□□□□ 0.03
ITGA3-201ENST00000007722 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms