RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ASAH2BP0C7U1 165 aa22.52■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ADH6P28332 368 aa22.52■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf53Q8N6V4 93 aa22.52■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 FKRPQ9H9S5 495 aa22.52■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 PLA2G3Q9NZ20 509 aa22.52■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 AKAP13Q12802 2813 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 EFNA2O43921 213 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKYO43930 277 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 DPP4P27487 766 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF1P41567 113 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 APOFQ13790 326 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1C1Q15619 314 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SNAPC1Q16533 368 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf140Q5VVS0 124 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 LNX2Q8N448 690 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TCEANCQ8N8B7 351 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC38A2Q96QD8 506 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 IL4I1Q96RQ9 567 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX12Q9BXU0 123 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 PRRG3Q9BZD7 231 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 OR11A1Q9GZK7 315 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF229Q9UJW7 825 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 BLOC1S6Q9UL45 172 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 KLK10O43240 276 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 XPNPEP2O43895 674 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFB2O95178 105 aa22.5■■□□□ 1.19
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CAPNS1-215ENST00000628018 GABARAPL2P60520 117 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 CSNK2BP67870 215 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 MFAP5Q13361 173 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKDD1AQ495B1 522 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM201Q5SNT2 666 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM69AQ5T7M9 428 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM26EQ8N5C1 309 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6S1Q8NH40 331 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF32Q9H0A6 362 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 HIF3AQ9Y2N7 669 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SURF4O15260 269 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGN1P05114 100 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN19P0C672 248 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 IL11P20809 199 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC6A6P31641 620 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXK1P85037 733 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A30Q5SVS4 291 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 IFT27Q9BW83 186 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SERINC1Q9NRX5 453 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 BAIAP2Q9UQB8 552 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3D21A4FU49 640 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5H15A6NDH6 313 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC3CA6NJW4 275 aa22.48■■□□□ 1.19
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CAPNS1-215ENST00000628018 AHSA1O95433 338 aa22.48■■□□□ 1.19
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CAPNS1-215ENST00000628018 CCL11P51671 97 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 PRPS1P60891 318 aa22.48■■□□□ 1.19
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CAPNS1-215ENST00000628018 OCLNQ16625 522 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM44Q2T9K0 475 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 MDS2Q8NDY4 140 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM163Q8TC26 289 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 DDIT4LQ96D03 193 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 CLN6Q9NWW5 311 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SCN3BQ9NY72 215 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TPRKBQ9Y3C4 175 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 PINLYPA6NC86 204 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM64CA6NLI5 447 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2T1O43869 369 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 UQCRC1P31930 480 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXO1Q12778 655 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB109BQ30KR1 87 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 GXYLT1Q4G148 440 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5M1Q8NGP8 315 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 HAS2Q92819 552 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 Q96MT0 163 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM173AQ9BQD7 235 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 POTEKPQ9BYX7 375 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP21Q9H596 190 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 DKKL1Q9UK85 242 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087WXM4 84 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 MCIDASD6RGH6 385 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 FTCDNL1E5RQL4 147 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM20BO75063 409 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6V1B1P15313 513 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SRD5A2P31213 254 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBA4AP68366 448 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35A2P78381 396 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXK2Q01167 660 aa22.47■■□□□ 1.19
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