RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPRY4Q9C004 299 aa25.86■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-210ENST00000574322 J3QRE1 110 aa25.85■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SOCS6O14544 535 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-210ENST00000574322 MYL12BO14950 172 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-210ENST00000574322 IDH3BO43837 385 aa25.85■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF3P17036 446 aa25.85■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GRINAQ7Z429 371 aa25.84■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PSD4Q8NDX1 1056 aa25.84■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC22A31A6NKX4 558 aa25.83■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 HAO2Q9NYQ3 351 aa25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF229Q9UJW7 825 aa25.83■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SSX1Q16384 188 aa25.83■■□□□ 1.72
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CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRC75AQ8NAA5 344 aa25.83■■□□□ 1.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF485Q8NCK3 441 aa25.83■■□□□ 1.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM234Q8WY98 164 aa25.83■■□□□ 1.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 ST8SIA1Q92185 356 aa25.83■■□□□ 1.72
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MPDZO75970 2070 aa25.82■■□□□ 1.72
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR11G2Q8NGC1 345 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 TEAD3Q99594 435 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 MED20Q9H944 212 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC6A5Q9Y345 797 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1-210ENST00000574322 MSX1P28360 303 aa25.81■■□□□ 1.72
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