RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 EBAG9O00559 213 aa29.61■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa29.61■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL9Q9P2J3 617 aa29.56■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PNV4 684 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 J3KTA2 159 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYTIPO60759 359 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFSF13O75888 250 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 VLDLRP98155 873 aa29.55■■■□□ 2.32
CTDNEP1-209ENST00000574205 GUSBP1Q15486 140 aa29.55■■■□□ 2.32
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