RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 NPIPB7O75200 414 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 ENTPD6O75354 484 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 SLC2A10O95528 541 aa16.01■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 SLC9A3P48764 834 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 CXCR4P61073 352 aa16.01■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 TSC22D3Q99576 134 aa16.01■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 NANSQ9NR45 359 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 DEPPQ9NTK1 212 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 GPR83Q9NYM4 423 aa16.01■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 CHRNA9Q9UGM1 479 aa16.01■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 NEURL1O76050 574 aa16■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 PPP1R3DO95685 299 aa16■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 WDPCPO95876 746 aa16■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 SCNM1Q9BWG6 230 aa16■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 MCIDASD6RGH6 385 aa16■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 CASRP41180 1078 aa16■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa16■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 TIGD3Q6B0B8 471 aa16■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 MOSPD2Q8NHP6 518 aa16■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 SEC14L4Q9UDX3 406 aa16■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa15.99■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15.99■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 TMEM185BQ9H7F4 350 aa15.99■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa15.98■□□□□ 0.15
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HERC2-208ENST00000566635 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 ERVK-18Q9QC07 812 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 LRRC3CA6NJW4 275 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 AHSA1O95433 338 aa15.98■□□□□ 0.15
HERC2-208ENST00000566635 PEPDP12955 493 aa15.98■□□□□ 0.15
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