RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564566.1

USP10-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-211ENST00000564566 CA10Q9NS85 328 aa14.79□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.79□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.79□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 AGR2O95994 175 aa14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 KCNJ10P78508 379 aa14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 H3F3AP84243 136 aa14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 SLC17A1Q14916 467 aa14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 AAED1Q7RTV5 226 aa14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 GPAT4Q86UL3 456 aa14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 ANKRD46Q86W74 232 aa14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 HOMEZQ8IX15 550 aa14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 RFLNBQ8N5W9 214 aa14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 ZG16BQ96DA0 208 aa14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 APOPT1Q96IL0 206 aa14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.78□□□□□ -0.04
USP10-211ENST00000564566 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 CRYAAP02489 173 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 OR4A8P0C604 315 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 TACR3P29371 465 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 HTR3AP46098 478 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 KHKP50053 298 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 TUBA1BP68363 451 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 TUBA4AP68366 448 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 PLAURQ03405 335 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 RUNX1T1Q06455 604 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 ADIPOQQ15848 244 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 TUBA1AQ71U36 451 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 POLE3Q9NRF9 147 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.77□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 B9A039 149 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 AKR7A3O95154 331 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 LGI1O95970 557 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 IL2RGP31785 369 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 CLDN8P56748 225 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 LGALS3BPQ08380 585 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 OR7A5Q15622 319 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 PMM1Q92871 262 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 TMEM45BQ96B21 275 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 SNX18Q96RF0 628 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 NR5A2O00482 541 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 ZNF208O43345 1280 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 SCN2BO60939 215 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 STAMBPO95630 424 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 DAOP14920 347 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 ARRB2P32121 409 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 SLC1A3P43003 542 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 PPOXP50336 477 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 CHN2P52757 468 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 CEACAM7Q14002 265 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 RINLQ6ZS11 566 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 TMEM99Q8N816 258 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 PPCSQ9HAB8 311 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 A0A096LPE4 126 aa14.74□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 A0A1W2PPZ6 126 aa14.74□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 TLDC2A0PJX2 215 aa14.74□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 SPAG7O75391 227 aa14.74□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 PDE5AO76074 875 aa14.74□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 GPIP06744 558 aa14.74□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP10-211ENST00000564566 CECR9P0C854 216 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms