RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	ARL14	Q8N4G2	192 aa		16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	OR13H1	Q8NG92	308 aa		16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	OR2M2	Q96R28	347 aa		16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	GHITM	Q9H3K2	345 aa		16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	EMC7	Q9NPA0	242 aa		16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	GNG8	Q9UK08	70 aa		16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559	HSPB11	Q9Y547	144 aa		16.9	■□□□□ 0.3
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GTQ1	180 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN4	O14493	209 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA4F	O95754	770 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	CSTA	P01040	98 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	EDNRA	P25101	427 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	HCCS	P53701	268 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	PRPS1	P60891	318 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	CD276	Q5ZPR3	534 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	PHF21A	Q96BD5	680 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	NCDN	Q9UBB6	729 aa		16.89	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SERINC4	A6NH21	518 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	PDCD5	O14737	125 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ST6GAL1	P15907	406 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	HHEX	Q03014	270 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	DYRK1A	Q13627	763 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	DGAT2	Q96PD7	388 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	FAM60A	Q9NP50	221 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	REV3L	O60673	3130 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF749	O43361	778 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SPI1	P17947	270 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	HTR2B	P41595	481 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1CA	P62136	330 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	FAM53B	Q14153	422 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	FCN2	Q15485	313 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SIAH3	Q8IW03	269 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	OR14A2	Q96R54	314 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		16.88	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	MYO9B	Q13459	2157 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPK0	400 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	GNB5	O14775	395 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	HCRTR1	O43613	425 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ITGA10	O75578	1167 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	OR7A10	O76100	309 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	IGF2	P01344	180 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	CD3G	P09693	182 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	TYRP1	P17643	537 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	HTR4	Q13639	388 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SNAPC3	Q92966	411 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	SPACA7	Q96KW9	195 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	NMNAT3	Q96T66	252 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	DDO	Q99489	341 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	S1PR5	Q9H228	398 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	OR51J1	Q9H342	316 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	DIABLO	Q9NR28	239 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		16.87	■□□□□ 0.29
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		16.87	■□□□□ 0.29

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