RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CDK20	Q8IZL9	346 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	LIPH	Q8WWY8	451 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	C3orf49	Q96BT1	292 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SARAF	Q96BY9	339 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GNRHR2	Q96P88	292 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	VCX	Q9H320	206 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	DSN1	Q9H410	356 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	DEPP	Q9NTK1	212 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	MED11	Q9P086	117 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	NCKAP5	O14513	1909 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965		A0A1B0GWA3	101 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965		H3BNX3	289 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965		M0R3H8	397 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	AQP7	O14520	342 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SEC14L5	O43304	696 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ZIC3	O60481	467 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TPST2	O60704	377 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	NPIPB7	O75200	414 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	E2F6	O75461	281 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	VAMP5	O95183	116 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PMS2P2	O95744	297 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	HPR	P00739	348 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ADA	P00813	363 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	MT-ND1	P03886	318 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FAM87A	P0C7U9	286 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ANXA8	P13928	327 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	HK1	P19367	917 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GSTM3	P21266	225 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	HTR2A	P28223	471 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TACR3	P29371	465 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	RYK	P34925	604 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	LIMS1	P48059	325 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CDH12	P55289	794 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GFRA1	P56159	465 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CTBP2	P56545	445 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SPIB	Q01892	262 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GTF3C1	Q12789	2109 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	MICA	Q29983	383 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	RFX4	Q33E94	735 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SYT14P1	Q58G82	188 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	RAET1L	Q5VY80	246 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	COMTD1	Q86VU5	262 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GHDC	Q8N2G8	530 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	CADM2	Q8N3J6	435 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	SCAI	Q8N9R8	606 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	GATS	Q8NAP1	163 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	FAR1	Q8WVX9	515 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM239	Q8WW34	195 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHP1-208	ENST00000560965	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58

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