RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558961.1

BMP4-204, Transcript of bone morphogenetic protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene BMP4, Length 495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4-204ENST00000558961 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 SPG11Q96JI7 2443 aa10.01□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 FREM1Q5H8C1 2179 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 A0A1W2PNR3 127 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 CDHR4A6H8M9 788 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 DEFB108AA8MXU0 73 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 AP3D1O14617 1153 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ARPC2O15144 300 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 SIAH2O43255 324 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 DNPH1O43598 174 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 CYTIPO60759 359 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 KRT36O76013 467 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 PRKD3O94806 890 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 BCHEP06276 602 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 THBS1P07996 1170 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 PPP3CBP16298 524 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 IL7RP16871 459 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ATP6V1B2P21281 511 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 CRATP43155 626 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 HTR3AP46098 478 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 CLK1P49759 484 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 DIO1P49895 249 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 MAP2K6P52564 334 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 IST1P53990 364 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 EPS8Q12929 822 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 FLOT2Q14254 428 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 GNA13Q14344 377 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 RGNQ15493 299 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ZSWIM7Q19AV6 140 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 LIN52Q52LA3 116 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 PPP4R4Q6NUP7 873 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 STAC2Q6ZMT1 411 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 TMPPEQ6ZT21 453 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 BEND4Q6ZU67 534 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 HMGN2P46Q86SG4 172 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 PTOV1Q86YD1 416 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 PEX5LQ8IYB4 626 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ZNF440Q8IYI8 595 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 OR10A6Q8NH74 314 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ZNF563Q8TA94 476 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 SLCO4A1Q96BD0 722 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 MBD6Q96DN6 1003 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 OR5B2Q96R09 309 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 FOXC2Q99958 501 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 LIME1Q9H400 295 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 A4GALTQ9NPC4 353 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 CTPS2Q9NRF8 586 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ZNF226Q9NYT6 803 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 KLHL9Q9P2J3 617 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 SNX13Q9Y5W8 968 aa10□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ABCA4P78363 2273 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 A0A0G2JPF8 293 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 PMS2P2O95744 297 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ENPP1P22413 925 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 RYKP34925 604 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 KCNJ5P48544 419 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 PDK3Q15120 406 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 TMEM201Q5SNT2 666 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ZNF836Q6ZNA1 936 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 STK32CQ86UX6 486 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 DHFR2Q86XF0 187 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ADGRG3Q86Y34 549 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 MICU2Q8IYU8 434 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 OR2T12Q8NG77 320 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 SLC35B4Q969S0 331 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 TMEM19Q96HH6 336 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ARL5BQ96KC2 179 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ECSITQ9BQ95 431 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 MED18Q9BUE0 208 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ADAM19Q9H013 955 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 RAD21L1Q9H4I0 556 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 BCL2L10Q9HD36 194 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 FANCFQ9NPI8 374 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 KLHL28Q9NXS3 571 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 EDARQ9UNE0 448 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 CORO2BQ9UQ03 480 aa9.99□□□□□ -0.81
BMP4-204ENST00000558961 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms