RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	CHRM4	P08173	479 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	LINGO3	P0C6S8	592 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NR2F1	P10589	423 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	COX4I1	P13073	169 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	GGT1	P19440	569 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	HNF1A	P20823	631 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SFTPD	P35247	375 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	GZMK	P49863	264 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NUDT2	P50583	147 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CCR4	P51679	360 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MVD	P53602	400 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	DSTN	P60981	165 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	HPCA	P84074	193 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CHRNE	Q04844	493 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CHRNB3	Q05901	458 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TSC22D1	Q15714	1073 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MAPK14	Q16539	360 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	RABL3	Q5HYI8	236 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZNF544	Q6NX49	715 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MUC15	Q8N387	334 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZNF527	Q8NB42	609 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NFKBID	Q8NI38	313 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	POC1B	Q8TC44	478 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	STON2	Q8WXE9	905 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZG16B	Q96DA0	208 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	STAC	Q99469	402 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SDF2	Q99470	211 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NPAS1	Q99742	590 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ABCA1	O95477	2261 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	OR5H1	A6NKK0	313 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FXYD1	O00168	92 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NDUFS8	O00217	210 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NDUFAB1	O14561	156 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	LYZL6	O75951	148 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FAM107A	O95990	144 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	OPN1SW	P03999	348 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	KRT16	P08779	473 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	P2RX1	P51575	399 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	EFNA4	P52798	201 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PDK3	Q15120	406 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	RGN	Q15493	299 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MAPRE2	Q15555	327 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MAPK11	Q15759	364 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	STK11	Q15831	433 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CYP51A1	Q16850	503 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FAM166A	Q6J272	317 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SLC22A25	Q6T423	547 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	VRK2	Q86Y07	508 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FBXO27	Q8NI29	283 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TMEM19	Q96HH6	336 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CGREF1	Q99674	301 aa		6.04	□□□□□ -1.44

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