RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	EPS8	Q12929	822 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	MYBPH	Q13203	477 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	CBFB	Q13951	182 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	SQLE	Q14534	574 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	TESK1	Q15569	626 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	NPTX1	Q15818	432 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	PIF1	Q9H611	641 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	POLE3	Q9NRF9	147 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	EXD2	Q9NVH0	621 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	ARMCX1	Q9P291	453 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF175	Q9Y473	711 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048		A6NNC1	897 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048		H3BNH8	94 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	KLF4	O43474	513 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	KRT34	O76011	436 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	MFN2	O95140	757 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	ANP32D	O95626	131 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	PLAU	P00749	431 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	FES	P07332	822 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	GPX2	P18283	190 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	ELK4	P28324	431 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	SSTR2	P30874	369 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	CPOX	P36551	454 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	CD79B	P40259	229 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	DIO1	P49895	249 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	H3F3A	P84243	136 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	LTB	Q06643	244 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	KLF10	Q13118	480 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	SGCB	Q16585	318 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	DUSP7	Q16829	419 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	DPP10	Q8N608	796 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MDM2-234	ENST00000546048	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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