RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 ADIPOR1Q96A54 375 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 C3orf49Q96BT1 292 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 MED18Q9BUE0 208 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TPK1Q9H3S4 243 aa18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
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PACSIN3-211ENST00000539589 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 HTR3EA5X5Y0 456 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 IDSB3KWA1 339 aa18.5■□□□□ 0.55
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PACSIN3-211ENST00000539589 PMS2P1A4D2B8 440 aa18.5■□□□□ 0.55
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PACSIN3-211ENST00000539589 CELP19835 753 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TGM1P22735 817 aa18.5■□□□□ 0.55
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PACSIN3-211ENST00000539589 BDH1Q02338 343 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 MXD1Q05195 221 aa18.5■□□□□ 0.55
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PACSIN3-211ENST00000539589 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa18.5■□□□□ 0.55
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PACSIN3-211ENST00000539589 SLC30A2Q9BRI3 323 aa18.5■□□□□ 0.55
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PACSIN3-211ENST00000539589 KNTC1P50748 2209 aa18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 HEATR5AQ86XA9 2040 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 FUOMA2VDF0 154 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 RGS5O15539 181 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF264O43296 627 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 REM1O75628 298 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC2A5P22732 501 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 LCN1P31025 176 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 CCR4P51679 360 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 GALEQ14376 348 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ELOA3BQ3SY89 546 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD37Q7Z713 158 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF554Q86TJ5 538 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 KLBQ86Z14 1044 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 LYSMD2Q8IV50 215 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 C9orf40Q8IXQ3 194 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM99Q8N816 258 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 CYB561A3Q8NBI2 242 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ELOA3Q8NG57 546 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 OR10H4Q8NGA5 316 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 OR5M3Q8NGP4 307 aa18.49■□□□□ 0.55
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PACSIN3-211ENST00000539589 COPS7AQ9UBW8 275 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 CHRNA9Q9UGM1 479 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF337Q9Y3M9 751 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 HEXBP07686 556 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TNFSF8P32971 234 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR50Q13585 617 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM69BQ5VUD6 431 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC26A1Q9H2B4 701 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ASB6Q9NWX5 421 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 BABAM2Q9NXR7 383 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC39A1Q9NY26 324 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 KLHL21Q9UJP4 597 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 B4E171 279 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRTM2O43300 516 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ALOX12BO75342 701 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 OR7A10O76100 309 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX4O95219 450 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 SDC2P34741 201 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TSPAN7P41732 249 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 BCAP31P51572 246 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 POU4F2Q12837 409 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 DNASE1L3Q13609 305 aa18.48■□□□□ 0.55
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PACSIN3-211ENST00000539589 CSRP2Q16527 193 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D25Q3MII6 688 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC17Q8N6Y2 441 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 OR52E2Q8NGJ4 325 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 OR1N1Q8NGS0 311 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TBX5Q99593 518 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 TMED9Q9BVK6 235 aa18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 IGF2P01344 180 aa18.47■□□□□ 0.55
PACSIN3-211ENST00000539589 SBK2P0C263 348 aa18.47■□□□□ 0.55
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