RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, human

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-210	ENST00000507965	MYL2	P10916	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	HPGD	P15428	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	COX5A	P20674	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	PRPH2	P23942	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	LMO1	P25800	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ELK4	P28324	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	OR3A2	P47893	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	NUDT6	P53370	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	PPA1	Q15181	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965		Q6ZT83	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	FCRL1	Q96LA6	429 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CCT7	Q99832	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	REEP4	Q9H6H4	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	FANCF	Q9NPI8	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965		E7EQL1	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	RGS14	O43566	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	PLIN3	O60664	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CDC14B	O60729	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	GLRA3	O75311	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	IFNA2	P01563	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SHBG	P04278	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	FES	P07332	822 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	YES1	P07947	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	GSTA1	P08263	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ABHD2	P08910	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	LINC00032	P0C843	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	UROS	P10746	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC7A1	P30825	629 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF83	P51522	516 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	P2RX1	P51575	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CCR4	P51679	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CASP9	P55211	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	GALE	Q14376	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	PCLAF	Q15004	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	QPRT	Q15274	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	NRF1	Q16656	503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	DCST2	Q5T1A1	773 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965		Q6ZSR9	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	MISP	Q8IVT2	679 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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