RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 PRKAR2BP31323 418 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 CASP14P31944 242 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 RFC4P35249 363 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 BIDP55957 195 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 BCL2L1Q07817 233 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 OXA1LQ15070 435 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R7Q15435 360 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 ISXQ2M1V0 245 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 UTF1Q5T230 341 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM107Q6UX40 140 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 HSDL2Q6YN16 418 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF525Q8N782 197 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 CEP112Q8N8E3 955 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 C12orf42Q96LP6 360 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 FMO2Q99518 471 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 PPA2Q9H2U2 334 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL28Q9NXS3 571 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 ABCD2Q9UBJ2 740 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC7A8Q9UHI5 535 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL21Q9UJP4 597 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1W2PPV9 198 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC182A6NF36 153 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 HSD17B6O14756 317 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 HCRTR1O43613 425 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL41O60662 606 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SERF1AO75920 110 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 STAMBPO95630 424 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 CST1P01037 141 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SEMG1P04279 462 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF853P0CG23 659 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC166P0CW27 439 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 RBMY1CP0DJD4 496 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 DDOSTP39656 456 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PRRX1P54821 245 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PLP1P60201 277 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 GBE1Q04446 702 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 RCN1Q15293 331 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF77Q15935 545 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2G6Q5TZ20 316 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TFAP2EQ6VUC0 442 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 CDC20BQ86Y33 519 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 HPS6Q86YV9 775 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2L3Q8NG85 312 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 OR1L6Q8NGR2 347 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 OR9A1PQ8NGU1 263 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM110BQ8TC76 370 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PGLYRP4Q96LB8 373 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PANX2Q96RD6 677 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 DEFB126Q9BYW3 111 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM192AQ9GZU8 254 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 FOLH1BQ9HBA9 442 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TMED5Q9Y3A6 229 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SH3TC1Q8TE82 1336 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A075B6Q4 140 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 GFYI3L273 518 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 K7N7A8 449 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM50AO95807 157 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 IGHV3-23P01764 117 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT14P02533 472 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 AQP1P29972 269 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SHMT2P34897 504 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 P2RY4P51582 365 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 ENPEPQ07075 957 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 SCRN3Q0VDG4 424 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 OR5I1Q13606 314 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 GNMTQ14749 295 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 DGUOKQ16854 277 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 MICBQ29980 383 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-207ENST00000470201 CARD17Q5XLA6 110 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.9 ms