RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452271.6

SBSN-201, Transcript of suprabasin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBSN, Length 1,945 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSN-201ENST00000452271 IL1AP01583 271 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 LIMS3P0CW19 117 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 LIMS4P0CW20 117 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 TBXA2RP21731 343 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 DLSTP36957 453 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 CDH11P55287 796 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 OR1Q1Q15612 314 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 CD226Q15762 336 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 CADM3Q8N126 398 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 OR2T33Q8NG76 320 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 ELP5Q8TE02 316 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 TM9SF4Q92544 642 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 CCDC32Q9BV29 185 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 SLC35F4A4IF30 521 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 STMND1H3BQB6 276 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 MASP2O00187 686 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 CDC42EP2O14613 210 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 LYPD3O95274 346 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 PNLIPRP2P54317 469 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 NHLH1Q02575 133 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 SSPNQ14714 243 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 EXT1Q16394 746 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 JAM3Q9BX67 310 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 POLE4Q9NR33 117 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 MYOTQ9UBF9 498 aa14.95□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 TSPAN19P0C672 248 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 HTR1FP30939 366 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 LCN1P31025 176 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 TNFSF8P32971 234 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 CEP19Q96LK0 163 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 WDFY2Q96P53 400 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 MED18Q9BUE0 208 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 GPR87Q9BY21 358 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 C21orf140B9A014 251 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 TERTO14746 1132 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 OIP5O43482 229 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 PPM1BO75688 479 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 OR2J2O76002 312 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 IGHA1P01876 353 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 SLC1A3P43003 542 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 FBXW4P57775 412 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 PSPHP78330 225 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 RUNX1T1Q06455 604 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 ACSM1Q08AH1 577 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 MARCH3Q86UD3 253 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 POC5Q8NA72 575 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 RNF217Q8TC41 542 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 OIT3Q8WWZ8 545 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 ZNF559Q9BR84 538 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 UBQLN3Q9H347 655 aa14.94□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 UNC119BA6NIH7 251 aa14.93□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 DLL1O00548 723 aa14.93□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 CH25HO95992 272 aa14.93□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 GAAP10253 952 aa14.93□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 UBL4AP11441 157 aa14.93□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 GABRA5P31644 462 aa14.93□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 ADH7P40394 386 aa14.93□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.93□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 ZNF550Q7Z398 422 aa14.93□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 M1APQ8TC57 530 aa14.93□□□□□ -0.02
SBSN-201ENST00000452271 TMEM239Q8WW34 195 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms