RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 IKZF5Q9H5V7 419 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 NANOGQ9H9S0 305 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SPAG4Q9NPE6 437 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 POLE3Q9NRF9 147 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 YAE1D1Q9NRH1 226 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ICAM5Q9UMF0 924 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 LIPT1Q9Y234 373 aa10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CLDN24A6NM45 220 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 A8MV72 311 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 EVPLLA8MZ36 301 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 NME4O00746 187 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TNFSF11O14788 317 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 LINGO3P0C6S8 592 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 IL7RP16871 459 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 PPIBP23284 216 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 EIF1P41567 113 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SKP2Q13309 424 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GNA13Q14344 377 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 QPRTQ15274 297 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 NRF1Q16656 503 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SLC15A3Q8IY34 581 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 LILRA2Q8N149 483 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP24Q8N264 748 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 RNF148Q8N7C7 305 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 OR8J3Q8NGG0 315 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ZNF563Q8TA94 476 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 POC1BQ8TC44 478 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GPR119Q8TDV5 335 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 WDR60Q8WVS4 1066 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 HSD17B8Q92506 261 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ZG16BQ96DA0 208 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SH3GL1Q99961 368 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 LAT2Q9GZY6 243 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 RAD21L1Q9H4I0 556 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 PIF1Q9H611 641 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TIGARQ9NQ88 270 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CMTM6Q9NX76 183 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ABCD2Q9UBJ2 740 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 C5orf58C9J3I9 102 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 OVOL3O00110 214 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CLOCKO15516 846 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CXCL13O43927 109 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 AQP8O94778 261 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 FAM157CP0CG43 387 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 NQO1P15559 274 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 PRKCAP17252 672 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 PGCP20142 388 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 IL32P24001 234 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CRISP3P54108 245 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 DSCR9P59020 149 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 RAC1P63000 192 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 KCNJ10P78508 379 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 MERTKQ12866 999 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TMEM44Q2T9K0 475 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TMEM201Q5SNT2 666 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 HBMQ6B0K9 141 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GGNQ86UU5 652 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 PEX5LQ8IYB4 626 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 OR10D3Q8NH80 312 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 OR2V1Q8NHB1 315 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 MAL2Q969L2 176 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TMEM19Q96HH6 336 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 KLHL15Q96M94 604 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 ECSITQ9BQ95 431 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 RHNO1Q9BSD3 238 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SAP130Q9H0E3 1048 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SLC38A1Q9H2H9 487 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CALML5Q9NZT1 146 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TMEM181Q9P2C4 612 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 LPAR3Q9UBY5 353 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CUBNO60494 3623 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 C7orf72A4D263 438 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CFAP73A6NFT4 308 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 GJE1A6NN92 205 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 PLAUP00749 431 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 DBIP07108 87 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 NUDT7P0C024 238 aa10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PRAME-210ENST00000442481 CCNA2P20248 432 aa10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms