RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 HPGDSO60760 199 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 FZD7O75084 574 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 DFFBO76075 338 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ELK1P19419 428 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 DCTP40126 519 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 KIR2DL3P43628 341 aa6.25□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 MOB3CQ70IA8 216 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TMEM163Q8TC26 289 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 MTCP1P56278 107 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.24□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 TP53I3Q53FA7 332 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ZNF691Q5VV52 312 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TEX19Q8NA77 164 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 IGSF8Q969P0 613 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RAB3CQ96E17 227 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 APIPQ96GX9 242 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RASD1Q9Y272 281 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 WNT11O96014 354 aa6.24□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 DTYMKP23919 212 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 OPRD1P41143 372 aa6.24□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 SLC35A1P78382 337 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 PCK2Q16822 640 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.24□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.24□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 Q6ZSR6 202 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 BAGE3Q86Y29 109 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 BAGE2Q86Y30 109 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 FCRL1Q96LA6 429 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 IL17FQ96PD4 163 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 MT-ND4LP03901 98 aa6.24□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 GNG12Q9UBI6 72 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.24□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 F5P12259 2224 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 MROH6A6NGR9 719 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SLC16A6O15403 523 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 LAP3P28838 519 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 CSN1S1P47710 185 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ST7LQ8TDW4 575 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 PSD2Q9BQI7 771 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 INPP5KQ9BT40 448 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ARV1Q9H2C2 271 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 DECR2Q9NUI1 292 aa6.24□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
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