RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 CD40P25942 277 aa18.45■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 MVDP53602 400 aa18.45■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 MAPK11Q15759 364 aa18.45■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf71Q6IPW1 123 aa18.45■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa18.45■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 OR52N5Q8NH56 324 aa18.45■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 HS6ST2Q96MM7 605 aa18.45■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
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LIMS1-208ENST00000428064 TMEM120BA0PK00 339 aa18.44■□□□□ 0.54
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LIMS1-208ENST00000428064 ZSWIM7Q19AV6 140 aa18.44■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 LIN52Q52LA3 116 aa18.44■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 RNF220Q5VTB9 566 aa18.44■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ATG16L1Q676U5 607 aa18.44■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 CASP12Q6UXS9 341 aa18.44■□□□□ 0.54
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LIMS1-208ENST00000428064 BOD1Q96IK1 185 aa18.44■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 DHRS9Q9BPW9 319 aa18.44■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 CBLN4Q9NTU7 201 aa18.44■□□□□ 0.54
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LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
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LIMS1-208ENST00000428064 OR52E4Q8NGH9 312 aa18.43■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 SLC7A10Q9NS82 523 aa18.43■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 SLC6A13Q9NSD5 602 aa18.43■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ZIM2Q9NZV7 527 aa18.43■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa18.43■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 JMJD1CQ15652 2540 aa18.43■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 LIPT2A6NK58 231 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFS7O75251 213 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF83P51522 516 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 CRISP3P54108 245 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 TGFBR3Q03167 851 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 WBP2NLQ6ICG8 309 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF544Q6NX49 715 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A25Q6T423 547 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF836Q6ZNA1 936 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 DEPDC4Q8N2C3 294 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 WDR31Q8NA23 367 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 OR52P1PQ8NH57 321 aa18.42■□□□□ 0.54
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LIMS1-208ENST00000428064 RLIMQ9NVW2 624 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 UPB1Q9UBR1 384 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM21Q9UKJ8 722 aa18.42■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 AQP7P3A6NL99 342 aa18.41■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 TFPTP0C1Z6 253 aa18.41■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 CXCR1P25024 350 aa18.41■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 DSTNP60981 165 aa18.41■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 SPOCK1Q08629 439 aa18.41■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 TSPO2Q5TGU0 170 aa18.41■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 MUC15Q8N387 334 aa18.41■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 POMGNT2Q8NAT1 580 aa18.41■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa18.41■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 CACNG6Q9BXT2 260 aa18.41■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 TPT1P8Q9HAU6 139 aa18.41■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 POU2F3Q9UKI9 436 aa18.41■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 A0A096LPI6 279 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 H7C417 338 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 M0R1B8 84 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 CD5LO43866 347 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 TP53P04637 393 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 BCHEP06276 602 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 KITP10721 976 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ETFAP13804 333 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 MPGP29372 298 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 CRATP43155 626 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 DSCR9P59020 149 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 COPZ1P61923 177 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 CEACAM7Q14002 265 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 NXNQ6DKJ4 435 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 B3GLCTQ6Y288 498 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 VRK2Q86Y07 508 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL14Q8N1E6 418 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ZIC4Q8N9L1 334 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 OR9K2Q8NGE7 335 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 SLC38A5Q8WUX1 472 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35B4Q969S0 331 aa18.4■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ITCHQ96J02 903 aa18.4■□□□□ 0.54
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