RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APCP25054 2843 aa15.49■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM229AB2RXF0 380 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CGAP01215 116 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDELR2P33947 212 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR1Q1Q15612 314 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STK32CQ86UX6 486 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TUSC5Q8IXB3 177 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR6T1Q8NGN1 323 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF217Q8TC41 542 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STK35Q8TDR2 534 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC47A1Q96FL8 570 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MCHR1Q99705 422 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCO1Q9HAY6 547 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EMC3Q9P0I2 261 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCD2Q9UBJ2 740 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HEATR5AQ86XA9 2040 aa15.48■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A0B4J2E0 115 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A1B0GX12 115 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GSTA4O15217 222 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AHSA1O95433 338 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 YES1P07947 543 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IMPDH2P12268 514 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FPR1P21462 350 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GSK3BP49841 420 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR7A5Q15622 319 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1orf140Q5VVS0 124 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF613Q6PF04 617 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C5orf46Q6UWT4 87 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OTOGQ6ZRI0 2925 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GDF7Q7Z4P5 450 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF610Q8N9Z0 462 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WFDC6Q9BQY6 131 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRR14Q9BWN1 585 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C12orf49Q9H741 205 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FANCFQ9NPI8 374 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARL8BQ9NVJ2 186 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NDE1Q9NXR1 346 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ELOVL5Q9NYP7 299 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADA2Q9NZK5 511 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNN3Q9UGI6 736 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SH3GLB1Q9Y371 365 aa15.47■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DOCK7Q96N67 2140 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LIPT2A6NK58 231 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF724A8MTY0 619 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TPST2O60704 377 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPIPB7O75200 414 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLK2P20151 261 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIR2DL3P43628 341 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MNAT1P51948 309 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MXRA7P84157 204 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEACAM7Q14002 265 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRT72Q14CN4 511 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDK3Q15120 406 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPTX1Q15818 432 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYBRD1Q53TN4 286 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PAQR6Q6TCH4 344 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FITM2Q8N6M3 262 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LZICQ8WZA0 190 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC38A4Q969I6 547 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADPRHL2Q9NX46 363 aa15.46■□□□□ 0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TUBAL3A6NHL2 446 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CXCR6O00574 342 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POU2F1P14859 743 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SSTR2P30874 369 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD79BP40259 229 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCYT1AP49585 367 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H3F3AP84243 136 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ENTPD8Q5MY95 495 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BEND4Q6ZU67 534 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CARM1Q86X55 608 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PGAM4Q8N0Y7 254 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR4D11Q8NGI4 311 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TPD52L3Q96J77 140 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCDHAC1Q9H158 963 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CACNA1CQ13936 2221 aa15.45■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa15.44■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A087WUJ7 227 aa15.44■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF716A6NP11 495 aa15.44■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR171O14626 319 aa15.44■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHP2O43745 196 aa15.44■□□□□ 0.06
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2T1O43869 369 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms