RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 MYO10Q9HD67 2058 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 USP54Q70EL1 1684 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR171O14626 319 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V1G1O75348 118 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 IL1AP01583 271 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 IL7P13232 177 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ADH6P28332 368 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 RTL6Q6ICC9 239 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 C7orf34Q96L11 122 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 FZD6O60353 706 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2T7P0C7T2 308 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 BMP1P13497 986 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC22Q8N4W6 341 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF454Q8N9F8 522 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2T27Q8NH04 317 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TOMM40LQ969M1 308 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TXNDC15Q96J42 360 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 ALG12Q9BV10 488 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 NGBQ9NPG2 151 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 OLAHQ9NV23 265 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 EVPLQ92817 2033 aa15.14■□□□□ 0.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPAN4O14817 238 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 DRD5P21918 477 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SGPP1Q9BX95 441 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF281Q9Y2X9 895 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 EMC9Q9Y3B6 208 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MEN1O00255 615 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FPR3P25089 353 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 DAPP51397 102 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CLDN17P56750 224 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS2R31P59538 309 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1211LQ6NV74 962 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LANCL3Q6ZV70 420 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ITFG2Q969R8 447 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TWSG1Q9GZX9 223 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6T1Q8NGN1 323 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PHB2Q99623 299 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 HINT2Q9BX68 163 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NUP50Q9UKX7 468 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 A8MVM7 634 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GM2AP17900 193 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OPRL1P41146 370 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NKPD1Q17RQ9 610 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 HRASLS5Q96KN8 279 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PRAMEF25A6NGN4 478 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ACOT8O14734 319 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NARSO43776 548 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 B4GALT3O60512 393 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 HTR5AP47898 357 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF750Q32MQ0 723 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC22A6Q4U2R8 563 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 BORAQ6PGQ7 559 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 STEAP2Q8NFT2 490 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FGF14Q92915 247 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MYEOVQ96EZ4 313 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 OR52A5Q9H2C5 316 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF226Q9NYT6 803 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 RASD1Q9Y272 281 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 IFNA2P01563 188 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CD14P08571 375 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CYB561P49447 251 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC58Q4VC31 144 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PLCXD3Q63HM9 321 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00696Q6ZRV3 163 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SYNPRQ8TBG9 265 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MICU1Q9BPX6 476 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXQ1Q9C009 403 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CLDN24A6NM45 220 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PRAF2O60831 178 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NSA2O95478 260 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP2CBP62714 309 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP2CAP67775 309 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 CAMK2DQ13557 499 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 SGPP2Q8IWX5 399 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ESX1Q8N693 406 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP4-201ENST00000344528 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms