RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 OR52E2Q8NGJ4 325 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 OR52N1Q8NH53 320 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 HGDQ93099 445 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 BORCS5Q969J3 196 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 DACH2Q96NX9 599 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 TEAD3Q99594 435 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 OR51V1Q9H2C8 321 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 NRIP3Q9NQ35 241 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 NANSQ9NR45 359 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 TSPAN19P0C672 248 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 CXCR1P25024 350 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 CD79BP40259 229 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 OPRL1P41146 370 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 RPS7P62081 194 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 GXYLT1Q4G148 440 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 TMCO6Q96DC7 493 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 MOGAT1Q96PD6 335 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 SLC34A2O95436 690 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 ASAH2BP0C7U1 165 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 CRYBB2P43320 205 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 TPBGQ13641 420 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 CROCCP3Q8IVE0 287 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 ACBD7Q8N6N7 88 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 SUMF1Q8NBK3 374 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 OR4K13Q8NH42 304 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 GPR119Q8TDV5 335 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 DUSP19Q8WTR2 217 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 CMKLR1Q99788 373 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 IDH3BO43837 385 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 QPRTQ15274 297 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 ANKDD1AQ495B1 522 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 SDR9C7Q8NEX9 313 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 MOSPD2Q8NHP6 518 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 HAO2Q9NYQ3 351 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXD8-201ENST00000313173 CLUP10909 449 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 LTBQ06643 244 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 PCOLCEQ15113 449 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 RNF138Q8WVD3 245 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 UFD1Q92890 307 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 INPP5EQ9NRR6 644 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 MYOTQ9UBF9 498 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 METTL15A6NJ78 407 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 C12orf71A8MTZ7 269 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF806P0C7X5 589 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 SLC16A1P53985 500 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 ACSM1Q08AH1 577 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 FAM69BQ5VUD6 431 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 SLC15A4Q8N697 577 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM99Q8N816 258 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC75AQ8NAA5 344 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 MCFD2Q8NI22 146 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 TTC9Q92623 222 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 KATNB1Q9BVA0 655 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 FKRPQ9H9S5 495 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 TAS2R10Q9NYW0 307 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF229Q9UJW7 825 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 FBXL4Q9UKA2 621 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 SLC6A5Q9Y345 797 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 A3GALT2U3KPV4 340 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GVG6 124 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 UMODP07911 640 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 UQCRC1P31930 480 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 AQP2P41181 271 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 TMED10P49755 219 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 COL28A1Q2UY09 1125 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF404Q494X3 552 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 TAAR8Q969N4 342 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 ADGRL4Q9HBW9 690 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 SSR3Q9UNL2 185 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 ERVK-25P63136 954 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 GRINAQ7Z429 371 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 GALNT6Q8NCL4 622 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 SLC22A8Q8TCC7 542 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 S100ZQ8WXG8 99 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 MMP27Q9H306 513 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 AKIP1Q9NQ31 210 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 KLHL1Q9NR64 748 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXD8-201ENST00000313173 CLDN25C9JDP6 229 aa24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms