RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 SERGEFQ9UGK8 458 aa22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 DPP7Q9UHL4 492 aa22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1W2PPV9 198 aa22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 SNRPGP15A8MWD9 76 aa22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 NR2F1P10589 423 aa22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 OMPP47874 163 aa22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 SUSD6Q92537 303 aa22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 OSTF1Q92882 214 aa22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 AHSPQ9NZD4 102 aa22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 KCNK6Q9Y257 313 aa22.71■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 SCN3AQ9NY46 2000 aa22.7■■□□□ 1.23
PKDCC-201ENST00000294964 DISC1C4P0D8 188 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 VEGFDO43915 354 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 ECDO95905 644 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 ATP1B1P05026 303 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 C8orf89P0DMQ9 161 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 IFNGR2P38484 337 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 DLX5P56178 289 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 OR10H4Q8NGA5 316 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 SLC25A28Q96A46 364 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 ORAI1Q96D31 301 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 AICDAQ9GZX7 198 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 PRSS16Q9NQE7 514 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 P2RX2Q9UBL9 471 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 OR6C74A6NCV1 312 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 SERPINA3P01011 423 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 ASGR2P07307 311 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 GPR4P46093 362 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 TAS2R41P59536 307 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 TNFRSF17Q02223 184 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 PLBD1Q6P4A8 553 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 MENTQ9BUN1 341 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 TEX12Q9BXU0 123 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 MED17Q9NVC6 651 aa22.7■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 IL5P05113 134 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 SPP1P10451 314 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 TRAM1Q15629 374 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 MICBQ29980 383 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF671Q8TAW3 534 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 SMPDL3AQ92484 453 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 PGLYRP3Q96LB9 341 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 MFFQ9GZY8 342 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 RASL12Q9NYN1 266 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 OR52A4PA6NMU1 304 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 SGCEO43556 437 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 CD53P19397 219 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 COL19A1Q14993 1142 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 COX14Q96I36 57 aa22.69■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 C4orf51C9J302 202 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 NDUFS4O43181 175 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 FRS3O43559 492 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 MT-ND5P03915 603 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 POU2F2P09086 479 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 TYRP1P17643 537 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 DCAF12L2Q5VW00 463 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF793Q6ZN11 406 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF765Q7L2R6 523 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 IFNA4P05014 189 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 VSIG10L2P0DP72 767 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 ACHEP22303 614 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 RORAP35398 523 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 CAPZA2P47755 286 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 TAS2R38P59533 333 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 AP3S2P59780 193 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 UBE2NLQ5JXB2 153 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 METRNLQ641Q3 311 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 NDC1Q9BTX1 674 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 SLC22A11Q9NSA0 550 aa22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 REM1O75628 298 aa22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 KRT33AO76009 404 aa22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 UCHL1P09936 223 aa22.67■■□□□ 1.22
PKDCC-201ENST00000294964 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms