RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 PSMB10P40306 273 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 WASP42768 502 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 METTL11BQ5VVY1 283 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 FBXO42Q6P3S6 717 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 ZAR1Q86SH2 424 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 SLC35F2Q8IXU6 374 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 SNX33Q8WV41 574 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 SMIM10Q96HG1 83 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 PTCHD1Q96NR3 888 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 ZNF559Q9BR84 538 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 SEC22CQ9BRL7 303 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 PIPOXQ9P0Z9 390 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 CHRNA9Q9UGM1 479 aa13.73□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PP55 124 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 GXYLT2A0PJZ3 443 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 ANKRD61A6NGH8 418 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 GABARAPH6UMI1 98 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 ADAM11O75078 769 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 LDB3O75112 727 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 ECDO95905 644 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 ALDOBP05062 364 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 CD1AP06126 327 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 RAD52P43351 418 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 CST6Q15828 149 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 ELFN2Q5R3F8 820 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 APOOLQ6UXV4 268 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 SERPINA12Q8IW75 414 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 CDRT4Q8N9R6 151 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 ZNRF4Q8WWF5 429 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 SLC25A18Q9H1K4 315 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 POT1Q9NUX5 634 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 C14orf105Q9NVL8 296 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 KLK11Q9UBX7 282 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 COPS3Q9UNS2 423 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 PRELID1Q9Y255 219 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 TRIOO75962 3097 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GWA3 101 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 LRRC72A6NJI9 287 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 BRINP1O60477 761 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 SLC35G6P0C7Q6 338 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 CXCL2P19875 107 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 DPP4P27487 766 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 GGTLC2Q14390 218 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 FAM78AQ5JUQ0 283 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 STPG1Q5TH74 334 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 FCRLAQ7L513 359 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 TMEFF1Q8IYR6 380 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 POMGNT2Q8NAT1 580 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 LCN9Q8WX39 176 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 TM4SF19Q96DZ7 209 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 STACQ99469 402 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 ZNF426Q9BUY5 554 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 CA10Q9NS85 328 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 RDH8Q9NYR8 311 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 HCN3Q9P1Z3 774 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 KLHL9Q9P2J3 617 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 MGAT4CQ9UBM8 478 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 RABL2BQ9UNT1 228 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 SLC22A7Q9Y694 548 aa13.72□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 PLSCR5A0PG75 271 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 NAP1L6A6NFF2 107 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 ZNF860A6NHJ4 632 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 IFITM5A6NNB3 132 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 B3GALT2O43825 422 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 KRT33AO76009 404 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 DHODHQ02127 395 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 GAS6Q14393 721 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 NHLRC3Q5JS37 347 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 SLC25A25Q6KCM7 469 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 PRSS42Q7Z5A4 293 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 NCDNQ9UBB6 729 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 KIF25Q9UIL4 384 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 SCML1Q9UN30 329 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 TUBAL3A6NHL2 446 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 ACOD1A6NK06 481 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 A8MUA0 341 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 ZNF879B4DU55 563 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 AIPO00170 330 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 ITGA10O75578 1167 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 EML2O95834 649 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 GABRA3P34903 492 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 MAGEB1P43366 347 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 CLDN12P56749 244 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 TCEA2Q15560 299 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 C2orf27AQ580R0 203 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 OR6V1Q8N148 313 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 SPPL3Q8TCT6 385 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 HMGB4Q8WW32 186 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 SFXN2Q96NB2 322 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 OR2A5Q96R48 311 aa13.71□□□□□ -0.21
SYP-201ENST00000263233 NOX3Q9HBY0 568 aa13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms