RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 TNFP01375 233 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 EDNRAP25101 427 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 MAB21L1Q13394 359 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 TRIM2Q9C040 744 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 AUNIPQ9H7T9 357 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ERVK-19Q9WJR5 959 aa23.44■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CENPBD1B2RD01 187 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 MT-ND4P03905 459 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 EPXP11678 715 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 GABRG2P18507 467 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CLDN12P56749 244 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 HHEXQ03014 270 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CDK5R1Q15078 307 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 SLC35F2Q8IXU6 374 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ASB12Q8WXK4 309 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 YIPF5Q969M3 257 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 VSTM2LQ96N03 204 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CITED4Q96RK1 184 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CFAP54Q96N23 3096 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 PRR32B1ATL7 298 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 NDUFB2O95178 105 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 TAS2R43P59537 309 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 TPRA1Q86W33 373 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 SERPINA12Q8IW75 414 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 POT1Q9NUX5 634 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF222Q9UK12 451 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa23.43■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CSTAP01040 98 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CXCL3P19876 107 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 SIRPAP78324 504 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 HES5Q5TA89 166 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 OR11H7Q8NGC8 314 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 MOSPD2Q8NHP6 518 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 HSPA12BQ96MM6 686 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 KLHDC3Q9BQ90 382 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 C2orf42Q9NWW7 574 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 OR10H1Q9Y4A9 318 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 OTPQ5XKR4 325 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 PYHIN1Q6K0P9 492 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ULK3Q6PHR2 472 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 TOMM5Q8N4H5 51 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 GPBAR1Q8TDU6 330 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 SMIM19Q96E16 107 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 SGTBQ96EQ0 304 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 HAO2Q9NYQ3 351 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 EML5Q05BV3 1969 aa23.42■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 OR5K3A6NET4 321 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 SEMA4FO95754 770 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CT45A8P0DMV1 189 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CT45A9P0DMV2 189 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CT45A2Q5DJT8 189 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 TIGD3Q6B0B8 471 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF511Q8NB15 262 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 MED28Q9H204 178 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 SERTAD3Q9UJW9 196 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 SCML1Q9UN30 329 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 FLRT2O43155 660 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 LBX1P52954 281 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 MAZP56270 477 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ACTC1P68032 377 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ACTA1P68133 377 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 STPG1Q5TH74 334 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 C16orf52Q8NHV5 167 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF671Q8TAW3 534 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 LGALS14Q8TCE9 139 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 NOX4Q9NPH5 578 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa23.41■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 PTHLHP12272 177 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CCR4P51679 360 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 PON3Q15166 354 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 CCDC58Q4VC31 144 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 LINC00114Q6XXX2 140 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 OOSP2Q86WS3 158 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 MS4A15Q8N5U1 240 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 LSMEM1Q8N8F7 131 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 NPEPL1Q8NDH3 523 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 NCDNQ9UBB6 729 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 SLC23A1Q9UHI7 598 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 OIP5O43482 229 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 RPP14O95059 124 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 TCRBP04435 133 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 IGHV4-34P06331 123 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 TNK1Q13470 666 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF524Q96C55 264 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RAB40C-201ENST00000248139 S1PR5Q9H228 398 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms