RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pum1Q80U78 1189 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem198bQ8CFU0 350 aa11.7□□□□□ -0.54
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trbc1A0A0A6YWV4 173 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhgb8A0A140LI48 931 aa11.69□□□□□ -0.54
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ArafP04627 604 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rln1P47932 185 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tra2bP62996 288 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm45902Q3UDN3 361 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nrsn2Q5HZK2 202 aa11.69□□□□□ -0.54
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef39Q66JY6 344 aa11.69□□□□□ -0.54
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GgnQ80WJ1 673 aa11.69□□□□□ -0.54
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc10a6Q9CXB2 373 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyc1Q9D0M3 325 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem43Q9DBS1 400 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap3s1Q9DCR2 193 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfrsf22Q9ER62 198 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nrip3Q9JJR9 240 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B4galt2Q9Z2Y2 369 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1315-ps1A0A140LI66 314 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gsg1lD3Z7H4 322 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Susd5G3UW60 619 aa11.69□□□□□ -0.54
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf13O54965 381 aa11.69□□□□□ -0.54
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp3r1Q63810 170 aa11.69□□□□□ -0.54
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