RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635258.1

LINC01427-202, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1427, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC01427, Length 4,566 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01427-202ENST00000635258 A0A1W2PQ72 361 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 H3BML4 177 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 HLA-DPB1P04440 258 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 RAPSNQ13702 412 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 ATP1A4Q13733 1029 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 RNFT2Q96EX2 444 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 OXGR1Q96P68 337 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 RNF32Q9H0A6 362 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 OR52D1Q9H346 318 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 RASSF1Q9NS23 344 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 RHCGQ9UBD6 479 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 HTR1AP08908 422 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 ZNF773Q6PK81 442 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 OR51A7Q8NH64 312 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 FBXO27Q8NI29 283 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 C1orf198Q9H425 327 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 THADAQ6YHU6 1953 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 TRABD2BA6NFA1 517 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 MED26O95402 600 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 GKN3PP0CG01 181 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 MAGEA2P43356 314 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 ECH1Q13011 328 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 MED22Q15528 200 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 TMEM163Q8TC26 289 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 TM9SF2Q99805 663 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 CASKO14936 926 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 SLC16A6O15403 523 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 ARHGEF9O43307 516 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 DIRAS1O95057 198 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 RIDAP52758 137 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 RAC1P63000 192 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 AAED1Q7RTV5 226 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 ZNF566Q969W8 418 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 A0A1B0GVI7 797 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 SNPHO15079 494 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 DLGAP3O95886 979 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 H2BFMP0C1H6 154 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 NPIPA8P0DM63 369 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 S1PR1P21453 382 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 PEX19P40855 299 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 SOX3P41225 446 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 GPR4P46093 362 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 GABRA4P48169 554 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 GPR85P60893 370 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 CHAF1BQ13112 559 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 FAM198BQ6UWH4 519 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 AHSA2Q719I0 299 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 PIP4P1Q86T03 277 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 RASL10BQ96S79 203 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC01427-202ENST00000635258 MRI1Q9BV20 369 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms