RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	POLE3	Q9NRF9	147 aa		12.03	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	C4orf47	A7E2U8	309 aa		12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SLC19A2	O60779	497 aa		12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	GRPR	P30550	384 aa		12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	ALG5	Q9Y673	324 aa		12.02	□□□□□ -0.48
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN4	O14493	209 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CTNS	O60931	367 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFB2	O95178	105 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-DQB1	P01920	261 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TFPI	P10646	304 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	FGFBP1	Q14512	234 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	KRT74	Q7RTS7	529 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SNX33	Q8WV41	574 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ORAI1	Q96D31	301 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OR10A5	Q9H207	317 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GNG8	Q9UK08	70 aa		12.02	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SHISA7	A6NL88	538 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GAA	P10253	952 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SDHB	P21912	280 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GAL	P22466	123 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	THBS2	P35442	1172 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PSMB10	P40306	273 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ATP12A	P54707	1039 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ERVK-25	P63136	954 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	BCORP1	Q8N888	145 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PMM1	Q92871	262 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	RASD2	Q96D21	266 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SGTB	Q96EQ0	304 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	KCNJ15	Q99712	375 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152		A8MUA0	341 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SELENOF	O60613	162 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PRAMEF2	O60811	474 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ALAS2	P22557	587 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GPR3	P46089	330 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GFER	P55789	205 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF550	Q7Z398	422 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	THAP4	Q8WY91	577 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TGM7	Q96PF1	710 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SNX18	Q96RF0	628 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	CACNA1C	Q13936	2221 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GVT2	93 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	MTFR2	Q6P444	385 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	GPR135	Q8IZ08	494 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	PELI1	Q96FA3	418 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ABHD1	Q96SE0	405 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		12.01	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SERINC4	A6NH21	518 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	IDS	B3KWA1	339 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	FAM157B	P0CG42	384 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	RAB3B	P20337	219 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	BLK	P51451	505 aa		12	□□□□□ -0.49
BRF1-222	ENST00000635152	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49

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