RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617719.4

ATXN3-251, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 1,074 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-251ENST00000617719 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 FOLH1BQ9HBA9 442 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 MID1IP1Q9NPA3 183 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 CTPS2Q9NRF8 586 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 SDHAF2Q9NX18 166 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 TREM2Q9NZC2 230 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 NDRG3Q9UGV2 375 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 ZNF229Q9UJW7 825 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 ANAPC2Q9UJX6 822 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 KCND3Q9UK17 655 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 RARRES3Q9UL19 164 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 ICKQ9UPZ9 632 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 LIPT1Q9Y234 373 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 PSAT1Q9Y617 370 aa4.2□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 A0A0X1KG70 313 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 A0A1W2PPH5 198 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 A0A1W2PPQ1 181 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 E9PLN8 166 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 H7C1Q1 480 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 CCDC188H7C350 402 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 J3QKU1 62 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 CES2O00748 559 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 PHYHO14832 338 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 SLC16A6O15403 523 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 HSPA12AO43301 675 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 HCRTR1O43613 425 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 GMFGO60234 142 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 SPAG7O75391 227 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 MED6O75586 246 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 CEACAM4O75871 244 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 SLC22A5O76082 557 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 LGI1O95970 557 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 IL1AP01583 271 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 FTH1P02794 183 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 CYC1P08574 325 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 HCKP08631 526 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 OR56A5P0C7T3 313 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 EBLN1P0CF75 366 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 NR2F6P10588 404 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 RNH1P13489 461 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 CD1EP15812 388 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 ST6GAL1P15907 406 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 SPI1P17947 270 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 TCN2P20062 427 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 OGNP20774 298 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 NT5EP21589 574 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 IVDP26440 423 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 NMBRP28336 390 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 ERP29P30040 261 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 SHMT2P34897 504 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 RYKP34925 604 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 DLSTP36957 453 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 CDKN2CP42773 168 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 KCNJ1P48048 391 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 PITPNBP48739 271 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 TTPAP49638 278 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 GPR143P51810 404 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 LUMP51884 338 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 ZNF45Q02386 682 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 ACSM1Q08AH1 577 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 TSPAN31Q12999 210 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 IL24Q13007 206 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 GAGE1Q13065 139 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 PRKAA1Q13131 559 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 TUBB3Q13509 450 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 ASAH1Q13510 395 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 DNASE1L3Q13609 305 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 HNF4GQ14541 408 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 KCNJ11Q14654 390 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 KIR2DS3Q14952 304 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 TAB1Q15750 504 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 ZIC1Q15915 447 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 SLC5A12Q1EHB4 618 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 FAM153CQ494X1 144 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 TMEM35AQ53FP2 167 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 GPR107Q5VW38 600 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 OR5M10Q6IEU7 315 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 LCN10Q6JVE6 187 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 AFTPHQ6ULP2 937 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 SPESP1Q6UW49 350 aa4.19□□□□□ -1.74
ATXN3-251ENST00000617719 ISLR2Q6UXK2 745 aa4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms