RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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PTPRF-216ENST00000617451 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 WDR31Q8NA23 367 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 OR52E4Q8NGH9 312 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM158Q8WZ71 300 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 NEURL3Q96EH8 262 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R36Q96LQ0 422 aa21.88■■□□□ 1.09
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PTPRF-216ENST00000617451 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM181Q9P2C4 612 aa21.88■■□□□ 1.09
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PTPRF-216ENST00000617451 KCNK17Q96T54 332 aa21.84■■□□□ 1.09
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PTPRF-216ENST00000617451 BMP4P12644 408 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTPRF-216ENST00000617451 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 TSPO2Q5TGU0 170 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTPRF-216ENST00000617451 AGAP5A6NIR3 686 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINE1P05121 402 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRF-216ENST00000617451 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRF-216ENST00000617451 SLC1A3P43003 542 aa21.82■■□□□ 1.08
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