RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
CTDP1-208ENST00000613122 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa18.77■□□□□ 0.6
CTDP1-208ENST00000613122 BCL6P41182 706 aa18.77■□□□□ 0.6
CTDP1-208ENST00000613122 FNDC8Q8TC99 324 aa18.77■□□□□ 0.6
CTDP1-208ENST00000613122 UBXN10Q96LJ8 280 aa18.77■□□□□ 0.6
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF681Q96N22 645 aa18.77■□□□□ 0.6
CTDP1-208ENST00000613122 MAOAP21397 527 aa18.77■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 IL2RGP31785 369 aa18.77■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 SPOCK1Q08629 439 aa18.77■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM64Q6YI46 380 aa18.77■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD60Q9BZ19 345 aa18.77■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 METTL15A6NJ78 407 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 J3KTA2 159 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 TP53P04637 393 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 HTR2AP28223 471 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 CSNK1G2P78368 415 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 MTFR2Q6P444 385 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 GDPD1Q8N9F7 314 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 NT5C3BQ969T7 300 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 SULT4A1Q9BR01 284 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 C1orf198Q9H425 327 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 EGLN3Q9H6Z9 239 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 V9GY05 133 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ETV5P41161 510 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 CYCSP99999 105 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ESCO2Q56NI9 601 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 SLC16A9Q7RTY1 509 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 SORCS2Q96PQ0 1159 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 METTL9Q9H1A3 318 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF587BE7ETH6 402 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 TSFMP43897 325 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 SLC35F3Q8IY50 421 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 LINC01465Q8N7H1 131 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 BCL7BQ9BQE9 202 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 FGF22Q9HCT0 170 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD10Q9NXR5 420 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 FURINP09958 794 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 TSPAN31Q12999 210 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 NLKQ9UBE8 527 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 NME7Q9Y5B8 376 aa18.76■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 WNT11O96014 354 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 AKAIN1P0CW23 69 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 OPRD1P41143 372 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 CX3CR1P49238 355 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 TM4SF18Q96CE8 201 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 DECR2Q9NUI1 292 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM64CA6NLI5 447 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ITGAMP11215 1152 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 DRD5P21918 477 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 AFMIDQ63HM1 303 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 OR5B12Q96R08 314 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 KATNB1Q9BVA0 655 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 PBDC1Q9BVG4 233 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ASB4Q9Y574 426 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 S100PBPQ96BU1 408 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 TBX21Q9UL17 535 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ALS2Q96Q42 1657 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 RGPD1P0DJD0 1748 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 PRAMEF25A6NGN4 478 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 AP1G1O43747 822 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF585AQ6P3V2 769 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF740Q8NDX6 193 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 OR56B2PQ8NGI1 322 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 FBXO27Q8NI29 283 aa18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 GPR176Q14439 515 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 SLX4IPQ5VYV7 408 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFAF7Q7L592 441 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 TPRA1Q86W33 373 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 COQ3Q9NZJ6 369 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 PLCH1Q4KWH8 1693 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 NUDT7P0C024 238 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 METRNLQ641Q3 311 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 SLC38A5Q8WUX1 472 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 NICN1Q9BSH3 213 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 SLC19A3Q9BZV2 496 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 MED16Q9Y2X0 877 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF814B7Z6K7 855 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 IL7P13232 177 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 SEMA3BQ13214 749 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 SLC48A1Q6P1K1 146 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 ABHD17CQ6PCB6 329 aa18.74■□□□□ 0.59
CTDP1-208ENST00000613122 RNF128Q8TEB7 428 aa18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms