RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 GABRA5P31644 462 aa19.92■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF546Q86UE3 836 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 LILRA2Q8N149 483 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 SLAMF9Q96A28 289 aa19.92■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 A0A0G2JNG1 304 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 KIR2DS3K7RE56 304 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 RFXAPO00287 272 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 FZD7O75084 574 aa19.92■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 PDE7AQ13946 482 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 KIR2DS5Q14953 304 aa19.92■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 FCRL1Q96LA6 429 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 MED20Q9H944 212 aa19.92■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC6A11P48066 632 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 SLC7A9P82251 487 aa19.92■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZNX1 250 aa19.92■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa19.91■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 VEGFCP49767 419 aa19.91■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 GPR75O95800 540 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 F13BP05160 661 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 TANGO2Q6ICL3 276 aa19.9■□□□□ 0.78
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